Characterization of Rhizoctonia solani isolates, from tobacco seedlings, with conventional and molecular methods

see the original item page
in the repository's web site and access all digital files if the item*

2009 (EN)
Χαρακτηρισμός απομονώσεων του μύκητα Rhizoctonia Solani, από σπορόφυτα καπνού, με συμβατικές και μοριακές μεθόδους
Characterization of Rhizoctonia solani isolates, from tobacco seedlings, with conventional and molecular methods

Γκουζιώτης, Απόστολος Παντελή

Rhizoctonia solani is a soil-borne pathogen that causes economically important diseases in many crop species. It is known to cause damping-off as well as crown rot in tobacco seedlings. The aim of this study was to characterize isolates of R. solani associated with tobacco in Greece. For this purpose 89 pathogen isolates were obtained during the spring of 2007, from diseased tobacco seedling plants from nurseries located in the main tobacco-growing areas in Northern Greece. The isolates were characterized using several conventional characteristics such as number of nuclei, mycelial growth rate, sclerotia production, virulence and hyphal anastomosis reactions using tester isolates of known AG groups. Among the 89 isolates tested, 87 were multinucleate and only 2 were binucleate. Molecular characterization was carried out in 39 out of 87 multinucleate isolates, using sequence analysis of the genomic regions encoding the internal transcribed spacers ITS1 and ITS4 for AG determination. Molecular analysis classified 27 of the isolates within the anastomosis group AG-2-1, 11 isolates belonged to AG-4 (6 isolates to the subgroup HG-I and 5 isolates to the subgroup HG-III) and a single isolate belonged to AG-5. Moreover, sequence analysis of the polymerase chain reaction (PCR)-amplified internal transcribed spacer (ITS) rDNA region was used for phylogenetic analysis. This is the first study of the relative AG composition of R. solani populations causing disease in tobacco seedlings in Greece.
Ο μύκητας Rhizoctonia solani είναι ένα εδαφογενές παθογόνο που προκαλεί οικονομικά σημαντικές ασθένειες σε πολλά καλλιεργούμενα φυτικά είδη. Μεταξύ αυτών, ιδιαίτερα σημαντικές είναι και οι προσβολές που εκδηλώνονται με τη μορφή προ- και μεταφυτρωτικών τήξεων στον καπνό. Ο σκοπός αυτής της έρευνας ήταν ο χαρακτηρισμός απομονώσεων του μύκητα R. solani από νεαρά φυτά καπνού στην Ελλάδα. Για το σκοπό αυτό, κατά τη διάρκεια της άνοιξης του 2007, συλλέχθηκαν 89 απομονώσεις του παθογόνου από σπορεία καπνοπαραγωγικών περιοχών της Βόρειας Ελλάδας. Οι απομονώσεις χαρακτηρίστηκαν με τη χρήση συμβατικών κριτηρίων όπως ο αριθμός πυρήνων, ο ρυθμός μυκηλιακής ανάπτυξης, η παραγωγή σκληρωτίων, η μολυσματικότητα σε διάφορους ξενιστές και οι αντιδράσεις αναστόμωσης με χαρακτηριστικούς αντιπροσώπους των ομάδων αναστόμωσης. Από τις 89 απομονώσεις που εξετάστηκαν οι 87 ήταν πολυπύρηνες και οι 2 διπύρηνες. Σε 39 από τις 87 πολυπύρηνες απομονώσεις έγινε μοριακός χαρακτηρισμός βασισμένος στην ανάλυση των μη μεταγραφόμενων περιοχών του ριβοσωμικού DNA (ITS1 και ITS4). Τα δεδομένα των μοριακών αναλύσεων έδειξαν ότι η πλειονότητα των απομονώσεων αυτών ανήκε στην ομάδα αναστόμωσης AG-2-1 (27 απομονώσεις), 11 απομονώσεις ανήκαν στην ομάδα AG-4 (6 απομονώσεις στην υποομάδα HG-I και 5 απομονώσεις στην υποομάδα HG-III), ενώ μία απομόνωση ανήκε στην ομάδα AG-5. Η ανάλυση της αλληλουχίας του ITS, η οποία πολλαπλασιάστηκε με τη χρήση της αλυσιδωτής αντίδρασης της πολυμεράσης (PCR), χρησιμοποιήθηκε για φυλογενετικές αναλύσεις. Αυτή είναι η πρώτη μελέτη διερεύνησης της ποικιλομορφίας απομονώσεων του μύκητα R. solani από τον καπνό στην Ελλάδα.

Postgraduate Thesis / Μεταπτυχιακή Εργασία

Χαρακτηρισμός απομονώσεων
Φυλογενετική ανάλυση
Rhizoctonia solani

Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (EL)
Aristotle University of Thessaloniki (EN)



Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης, Γεωπονική Σχολή

This record is part of 'IKEE', the Institutional Repository of Aristotle University of Thessaloniki's Library and Information Centre found at Unless otherwise stated above, the record metadata were created by and belong to Aristotle University of Thessaloniki Library, Greece and are made available to the public under Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International license ( Unless otherwise stated in the record, the content and copyright of files and fulltext documents belong to their respective authors. Out-of-copyright content that was digitized, converted, processed, modified, etc by AUTh Library, is made available to the public under Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International license ( You are kindly requested to make a reference to AUTh Library and the URL of the record containing the resource whenever you make use of this material.

*Institutions are responsible for keeping their URLs functional (digital file, item page in repository site)