Tracking Single-Cells in Overcrowded Bacterial Colonies

 
δείτε την πρωτότυπη σελίδα τεκμηρίου
στον ιστότοπο του αποθετηρίου του φορέα για περισσότερες πληροφορίες και για να δείτε όλα τα ψηφιακά αρχεία του τεκμηρίου*
κοινοποιήστε το τεκμήριο





Tracking Single-Cells in Overcrowded Bacterial Colonies

Tsakanikas, Panagiotis
Balomenos, Athanasios D.
Manolakos, Elias S.

Cell tracking enables data extraction from timelapse "cell movies" and promotes modeling biological processes at the single-cell level. We introduce a new fully automated computational strategy to track accurately cells across frames in time-lapse movies. Our method is based on a dynamic neighborhoods formation and matching approach, inspired by motion estimation algorithms for video compression. Moreover, it exploits "divide and conquer" opportunities to solve effectively the challenging cells tracking problem in overcrowded bacterial colonies. Using cell movies generated by different labs we demonstrate that the accuracy of the proposed method remains very high (exceeds 97%) even when analyzing large overcrowded microbial colonies.

Text
Text (Conference or workshop item (Paper))

βιολογία


Αγγλική γλώσσα

2015





*Η εύρυθμη και αδιάλειπτη λειτουργία των διαδικτυακών διευθύνσεων των συλλογών (ψηφιακό αρχείο, καρτέλα τεκμηρίου στο αποθετήριο) είναι αποκλειστική ευθύνη των αντίστοιχων Φορέων περιεχομένου.