Ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού

Το τεκμήριο παρέχεται από τον φορέα :
Πανεπιστήμιο Αιγαίου   

Αποθετήριο :
Ιδρυματικό Αποθετήριο Ελλάνικος (Hellanicus)   

δείτε την πρωτότυπη σελίδα τεκμηρίου
στον ιστότοπο του αποθετηρίου του φορέα για περισσότερες πληροφορίες και για να δείτε όλα τα ψηφιακά αρχεία του τεκμηρίου*



Ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού

Γεωργίου, Θεοδώρα - Ιωάννης

Γιαννακόπουλος, Αθανάσιος

masterThesis

2005
2015-11-22T15:59:23Z


Sequence alignment is very useful in finding functional, structural, and evolutional information in biological sequences. It is very important to find the best possible alignment in order to extract this information. Sequences that are similar, possibly do the same function, whether it is a prescriptive part in the case of similar DNA molecules, or a biochemical function and 3-dimensional structure in the case of proteins. The aim of this study is to retrieve protein sequences of the same class from protein databases, to align them using different algorithms of dynamic programming, and finally to compare and evaluate the results generated from the different algorithms.
Η αντιστοίχιση αλληλουχιών είναι χρήσιμη για την εύρεση λειτουργικών, δομικών, και εξελικτικών πληροφοριών σε βιολογικές ακολουθίες. Είναι σημαντικό να βρίσκουμε την καλύτερη δυνατή ή αλλιώς «βέλτιστη» αντιστοίχιση για να εξάγουμε αυτές τις πληροφορίες. Αλληλουχίες οι οποίες είναι παρόμοιες, πιθανότατα έχουν την ίδια λειτουργία, είτε είναι ένας ρυθμιστικός ρόλος στην περίπτωση παρόμοιων μορίων DNA, είτε είναι μια παρόμοια βιοχημική λειτουργία και τρισδιάστατη δομή στην περίπτωση πρωτεϊνών. Σκοπός της παρούσας μελέτης είναι να ανακτήσει αλληλουχίες πρωτεϊνών τις ίδιας κλάσης από βάσεις δεδομένων, να τις αντιστοιχίσει χρησιμοποιώντας διαφορετικούς αλγόριθμους δυναμικού προγραμματισμού, και κατόπιν να συγκρίνει και να αξιολογήσει τα αποτελέσματα που παράγονται από τους διαφορετικούς αλγόριθμους.

Dynamic programming
Proteins--Analysis

Δυναμικός προγραμματισμός
Sequence alignment
Αντιστοίχιση αλληλουχιών
Dynamic programming
Πρωτεΐνη
Protein

Πανεπιστήμιο Αιγαίου. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Στατιστικής και Αναλογιστικών - Χρηματοοικονομικών Μαθηματικών. Στατιστική και Αναλογιστικά - Χρηματοοικονομικά Μαθηματικά.




*Η εύρυθμη και αδιάλειπτη λειτουργία των διαδικτυακών διευθύνσεων των συλλογών (ψηφιακό αρχείο, καρτέλα τεκμηρίου στο αποθετήριο) είναι αποκλειστική ευθύνη των αντίστοιχων Φορέων περιεχομένου.