δείτε την πρωτότυπη σελίδα τεκμηρίου στον ιστότοπο του αποθετηρίου του φορέα για περισσότερες πληροφορίες και για να δείτε όλα τα ψηφιακά αρχεία του τεκμηρίου*
Ανάλυση του γονιδιώματος του βακτηρίου Burkholderia nodosa DSM 21604 των φυματίων της Mimosa scabrella
ΕΠΙΣΚΟΠΟΥ ΓΕΩΡΓΙΟΣ
(EL)
ΕΠΙΣΚΟΠΟΥ ΓΕΩΡΓΙΟΣ
(EN)
Στόχος αυτής της διπλωματικής εργασίας είναι έκτος από το να παρουσιάσει κάποια βασικά χαρακτηριστικά (π.χ. μορφολογικά και γενετικά) για το ψυχανθές και το βακτήριο, να αποκαλύψει το μηχανισμό δημιουργίας αυτής της συμβιωτικής σχέσης και τα αμοιβαία οφέλη αυτής. Επιπλέον, σκοπός αυτής της μελέτης είναι να πραγματοποιηθεί φυλογενετική ανάλυση και να ταυτοποιηθεί η θέση του βακτηρίου Burkholderia nodosa type strain Br3437 στο Δέντρο της Ζωής και πιο συγκεκριμένα στο φυλογενετικό δέντρο εντός της οικογένειας Burkholderiaceae. Η μελέτη πραγματοποιήθηκε με απομόνωση και μοριακή ανάλυση του 16S rRNA γονιδίου. Χρησιμοποιώντας τις μεθόδους Neighbor Joining (NJ) και Maximum Likelihood (ML) κατασκευάστηκαν τα αντίστοιχα φυλογενετικά δέντρα που αποκαλύπτουν την εξελικτική πορεία του βακτηρίου Burkholderia nodosa και τις συγγενικές του σχέσεις με τα υπόλοιπα βακτήρια της οικογένειας Burkholderiaceae. Τέλος, πραγματοποιήθηκε μοριακή ανάλυση της νουκλεοτιδικής αλληλουχίας των γονιδίων nodABC καθώς και της αμινοξικής αλληλουχίας των πρωτεϊνών nodABC χρησιμοποιώντας το NCBI/BLAST.
(EL)
The aim of this thesis is to present the major basic characteristics (eg morphologically and genetically) of the legume and the bacterium and to reveal which signals are produced for the development of this symbiotic relationship along with its mutual benefits. In addition, the purpose of this study is to perform phylogenetic analysis and to identify the location of the Burkholderia nodosa type strain Br3437 in the Tree of Life and more specifically in the phylogenetic tree within the Burkholderiaceae family. The study was performed by isolation and molecular analysis of the 16S rRNA gene. Through the use of Neighbor Joining (NJ) and Maximum Likelihood (ML), the resulting constructed phylogenetic trees revealed the evolutionary course of the Burkholderia nodosa bacterium and its subsequent relationship with the other bacteria of the Burkholderiaceae family. Finally, molecular analysis of the nucleotide sequence of the nodABC genes and the amino acid sequence of the corresponding proteins was performed using NCBI/BLAST.
(EN)
*Η εύρυθμη και αδιάλειπτη λειτουργία των διαδικτυακών διευθύνσεων των συλλογών (ψηφιακό αρχείο, καρτέλα τεκμηρίου στο αποθετήριο) είναι αποκλειστική ευθύνη των αντίστοιχων Φορέων περιεχομένου.
Βοηθείστε μας να κάνουμε καλύτερο το OpenArchives.gr.
