Ανάλυση ποικιλότητας τριών πληθυσμών μαύρης πεύκης (pinus nigra) με τη χρήση μοριακών δεικτών τυχαία πολλαπλασιασμένου πολυμορφικού DNA (RAPD)

 
see the original item page
in the repository's web site and access all digital files if the item*
share




2008 (EN)
Analysis of diversity in three black pine (pinus nigra) populations using PCR-RAPD molecular markers
Ανάλυση ποικιλότητας τριών πληθυσμών μαύρης πεύκης (pinus nigra) με τη χρήση μοριακών δεικτών τυχαία πολλαπλασιασμένου πολυμορφικού DNA (RAPD)

Τραγουδάρα, Ελένη Δημητρίου

The variation of three black pine populations was studied using molecular markers (RAPD). These populations were from Greece (Metsovo), France (Gagners) and Austria (Alpes Seches). DNAextraction from endosperms was curned out with the use of a modified CTAB method protocol. There was also tested another protocol (Dneasy Plant Mini Kit, Riagen). PCR-RAPD variation was studied by employing six RAPD primers. Gene diversity was found to be high (He+-0,3570). Genetic diversity was also high and is found to be mostly in populations (Hs=0,3133) and less between them (Dst=0,043). The results of the present study shows that there is a close relation between the populations of Greece and France and the population of Austria is isolated from the other two.
Σκοπός της παρούσας εργασίας ήταν η ανάλυση γενετικής ποικιλότητας σε τρειςπληθυσμούς Μαύρης πεύκης (pinus nigra) με τη χρήση μοριακών δεικτών τύπουRAPD με τη μέθοδο της αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης. Από τουςπληθυσμούς αυτούς, ένας προέρχονταν από τον Ελλαδικό χώρο και συγκεκριμένααπό το Μέτσοβο, και δύο από το εξωτερικό, από τις χώρες της Γαλλίας (περιοχήGagneres) και Αυστρίας (περιοχή Alpes Seches). To φυτικό υλικό πουχρησιμοποιήθηκε ήταν το ενδοσπέρμιο των σπόρων, πενήντα ενδοσπέρμια ανάπληθυσμό. Η εκχύλιση του DNA από το ενδοσπέρμιο πραγματοποιήθηκε με τηνχρήση ενός τροποποιημένου πρωτοκόλλου της μεθόδου CTAB, αφού προηγουμένωςείχε δοκιμαστεί και η απομόνωση DNA με τη χρήση του σετ DneasyTM Plant MiniKit του οίκου QIAGEN. Στη συνέχεια εφαρμόστηκε η αλυσιδωτή αντίδρασηπολυμεράσης. Μετά από δοκιμή ενός ικανού αριθμού δεκαμερών εκκινητών RAPDεπιλέχθηκαν εκείνοι οι οποίοι έδιναν ευδιάκριτο και επαναλήψιμο προφίλ ζωνών.Ακολούθησε η καταγραφή των προϊόντων RAPD και στη συνέχεια η στατιστικήεπεξεργασία των στοιχείων με τη χρησιμοποίηση του προγράμματος στατιστικήςεπεξεργασίας POPGENE. Τα αποτελέσματα που εξήχθησαν από την στατιστικήανάλυση φανερώνουν την ύπαρξη μεγάλης γενετικής ποικιλότητας η οποίαεντοπίζεται κυρίως μέσα στους πληθυσμούς, με τιμή Hs= 0.3133, και λιγότερομεταξύ αυτών (Dst= 0.043) , παρόλο που όπως προέκυψε η διαφοροποίηση καιμεταξύ των πληθυσμών που μελετήθηκαν είναι σχετικά υψηλή. Η αναμενομένηετεροζυγωτία He κυµαίνονταν από 0.2734- 0.3473, ενώ η συνολική αναμενόµενηετεροζυγωτία ήταν 0.3570. Ο συντελεστής διαφοροποίησης βρέθηκε υψηλός Gst =12.25%. Οι γενετική απόσταση μεταξύ των πληθυσμών της Αυστρίας (Alpes Seches)και της Γαλλίας (Gagneres) ήταν 0.1065, μεταξύ των πληθυσμών της Γαλλίας(Gagneres) και της Ελλάδας (Μέτσοβο) ήταν 0.0597, ενώ μεταξύ των πληθυσμών τηςΑυστρίας (Alpes Seches) και της Ελλάδας (Μέτσοβο) ήταν 0.1045. Το δενδρόγραμματων σχέσεων των πληθυσμών δείχνει ότι οι πληθυσμοί της Γαλλίας και της Ελλάδαςσχηματίζουν μία ομάδα, ενώ ο πληθυσμός της Αυστρίας διαφοροποιείται από αυτήντην ομάδα.

info:eu-repo/semantics/masterThesis
Postgraduate Thesis / Μεταπτυχιακή Εργασία

Pinus nigra
Molecular markers
Μαύρη Πεύκη
RAPD
Γενετική ποικιλότητα
Genetic diversity
Μοριακοί δείκτες
PCR

Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (EL)
Aristotle University of Thessaloniki (EN)

2008
2009-06-21T21:00:00Z


Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης, Σχολή Γεωπονίας, Δασολογίας και Φυσικού Περιβάλλοντος, Τμήμα Δασολογίας και Φυσικού Περιβάλλοντος

This record is part of 'IKEE', the Institutional Repository of Aristotle University of Thessaloniki's Library and Information Centre found at http://ikee.lib.auth.gr. Unless otherwise stated above, the record metadata were created by and belong to Aristotle University of Thessaloniki Library, Greece and are made available to the public under Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International license (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0). Unless otherwise stated in the record, the content and copyright of files and fulltext documents belong to their respective authors. Out-of-copyright content that was digitized, converted, processed, modified, etc by AUTh Library, is made available to the public under Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International license (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0). You are kindly requested to make a reference to AUTh Library and the URL of the record containing the resource whenever you make use of this material.
info:eu-repo/semantics/openAccess



*Institutions are responsible for keeping their URLs functional (digital file, item page in repository site)