Αναλυτική έκθεση με δεδομένα σχετικά με τη μεθοδολογία και τους αλγορίθμους επεξεργασίας εικόνας από μικροσκόπιο για την καταμέτρηση του αριθμού των κυττάρων σε μικροβιακές κοινότητες (Π21-Δ5.1)
Αναλυτική έκθεση με δεδομένα σχετικά με τη μεθοδολογία και τους αλγορίθμους επεξεργασίας εικόνας από μικροσκόπιο για την καταμέτρηση του αριθμού των κυττάρων σε μικροβιακές κοινότητες (Π21-Δ5.1)
Περιλαμβάνεται ο ακόλουθος πίνακας περιεχομένων:
1. Εισαγωγή
1.1 Από τα μεμονωμένα κύτταρα (single cells) στις μικροαποικίες και τα βιοϋμένια
1.2 Αναγκαιότητα για την ανάπτυξη μεθοδολογίας
1.3 Δομή της αναφοράς
2. Υπάρχουσες Προσεγγίσεις (State of the art
2.1 Ήδη υπάρχοντα λογισμικά
2.2 Μεθοδολογία που αναπτύχθηκε
3. Μέθοδοι
3.1 Προεπεξεργασία εικόνας
3.2 Κατάτμηση αποικιών
3.3 Αλγόριθμος κατάτμησης μεμονωμένων κυττάρων
3.3.1 Επεξεργασία συγγραμμικών (collinear) αντικειμένων
3.3.2 Μοντέλα μίξης γκαουσιανών κατανομών (Gaussian Mixture Models)
3.3.3 Επεξεργασία πολύπλοκων (complex) αντικειμένων
4. Κυτταρικές ταινίες και Μέθοδος Αξιολόγησης
4.1 Περιγραφή κυτταρικών ταινιών
4.2 Μέθοδος Αξιολόγησης
5. Αποτελέσματα και Συζήτηση
5.1 Σύγκριση των αποτελεσμάτων της προτεινόμενης μεθοδολογίας με το Ground Truth
5.2 Σύγκριση της προτεινόμενης μεθοδολογίας με τα υπάρχοντα λογισμικά
5.3 Ανάλυση υπολογιστικής πολυπλοκότητας
6. Συμπεράσματα
