1. Αρχική σελίδα
  2. Αναζήτηση

Segmentation of microarray images using gaussian mixture models and wavelet based preprocessing filters

Το τεκμήριο παρέχεται από τον φορέα :
ΤΕΙ Αθήνας   

Αποθετήριο :
Υπατία - Ιδρυματικό Αποθετήριο   

δείτε την πρωτότυπη σελίδα τεκμηρίου
στον ιστότοπο του αποθετηρίου του φορέα για περισσότερες πληροφορίες και για να δείτε όλα τα ψηφιακά αρχεία του τεκμηρίου*



Segmentation of microarray images using gaussian mixture models and wavelet based preprocessing filters (EN)
Δασκαλάκης, Αντώνης (EL)
Σπυρίδωνος, Παναγιώτα Π. (EL)
Αθανασιάδης, Εμμανουήλ Ι. (EL)
Γκλώτσος, Δημήτριος (EL)
Κωστόπουλος, Σπυρίδων (EL)
Νικηφορίδης, Γεώργιος Σ. (EL)
Κάβουρας, Διονύσης Α. (EL)
Καλατζής, Ιωάννης (EL)
full paper
conferenceItem
2015-05-14
2015-05-14T15:26:29Z
2006
International Conference "From Scientific Computing to Computational Engineering" (EN)
The objective of this work was to investigate the segmentation capability of Gaussian Mixture Models (GMMs) on microarray images, using wavelet based image enhancement techniques. A Simulated Microarray image of 200 spots was produced using a Microarray Scan Simulator. The image was pre-processed using 3 different daub4 wavelet based filters, developed in MATLAB. The detail coefficients of the wavelet transform were processed up to scale 3 using Hard, Soft and Sigmoidal Thresholding. An automatic gridding process was developed and applied on the preprocessed microarray image with the purpose of identifying the spots. The GMMs algorithm was then applied to each spot in order to discriminate foreground from background. The segmentation capability of the GMMs was evaluated by calculating the segmentation matching factor for each spot. Optimal segmentation results were obtained by pre-processing the microarray image by all the waveletbased filters. Wavelet based preprocessing was found to improve the GMMs segmentability, in discriminating the spot’s foreground from background. (EN)
**N/A**-Τεχνολογία
http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh91006163
Βιοϊατρική τεχνολογία
http://zbw.eu/stw/descriptor/10470-6
Μικροσυστοιχίες
Wavelets (Mathematics)
Microarray
http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh85014237
**N/A**-Βιοϊατρική τεχνολογία
Τεχνολογία
Κυμάτιο
Technology
Biomedical engineering
Τ.Ε.Ι. Αθήνας. Σχολή Τεχνολογικών Εφαρμογών. Τμήμα Μηχανικών Βιοϊατρικής Τεχνολογίας Τ.Ε. (EL)
http://www.bme.teiath.gr/medisp/pdfs/ATHANASSIADIS_2006_SCCE_Segmentation%20Of%20Microarray%20Images.pdf
Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ηνωμένες Πολιτείες
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/
free
ΤΕΙ Αθήνας
Υπατία - Ιδρυματικό Αποθετήριο
Δημοσιεύσεις



*Η εύρυθμη και αδιάλειπτη λειτουργία των διαδικτυακών διευθύνσεων των συλλογών (ψηφιακό αρχείο, καρτέλα τεκμηρίου στο αποθετήριο) είναι αποκλειστική ευθύνη των αντίστοιχων Φορέων περιεχομένου.