Χαϊδάκη ΑθηνάΕισαγωγή: Ο ιός HIV είναι ο αιτιολογικός παράγοντας του AIDS. Ο ιός χαρακτηρίζεται από εκτενή γενετική ετερογένεια και ταξινομείται παγκοσμίως σε τέσσερις ομάδες, από τις οποίες η Μ είναι υπεύθυνη για την πανδημία του ΑIDS και ταξινομείται φυλογενετικά σε εννέα υπότυπους, υπό-υπότυπους και σε ανασυνδυασμένους τύπους. Η επιδημία του HIV-1 στην Ελλάδα μέχρι και το έτος 2010 αφορούσε κυρίως ομοφυλόφιλους άνδρες. Από το 2011 όμως παρατηρήθηκε μια ραγδαία αύξηση κρουσμάτων HIV-1 σε χρήστες ενδοφλέβιων ναρκωτικών (ΧΕΝ). Μέθοδοι: Μελετήθηκαν 65 αλληλουχίες οροθετικών ΧΕΝ, οι οποίοι προέρχονταν από χώρες της Ασίας, της Ευρώπης και της Αφρικής. Ο χαρακτηρισμός της νουκλεοτιδικής αλληλουχίας πραγματοποιήθηκε κατόπιν PCR αντίστροφης μεταγραφής και μη-εμπορικά διαθέσιμης διπλής PCR στις περιοχές της πρωτεάσης (PR) και αντίστροφης μεταγραφάσης (RT) και στη συνέχεια ακολούθησε φυλογενετική ανάλυση. Αποτελέσματα: Αναπτύχθηκε επιτυχώς μια μη-εμπορικά διαθέσιμη μέθοδος ταυτοποίησης της νουκλεοτιδικής αλληλουχίας του HIV για τις περιοχές της PR και της RT. Σύμφωνα με τα αποτελέσματα της φυλογενετικής ανάλυσης, ο υπότυπος που κυριαρχεί ανάμεσα στους ΧΕΝ είναι ο ανασυνδυασμένος τύπος CRF14_BG με ποσοστό επιπολασμού 72,3%. Ακολουθεί το ανασυνδυασμένο στέλεχος CRF35_ΑD και ο υπότυπος Β με ποσοστά επιπολασμού 12,3% και 9,2% αντίστοιχα. Με μικρότερη συχνότητα εμφανίζονται οι υπότυποι Α και Α1 με ποσοστά επιπολασμού 3,1% ο καθένας. Συμπεράσματα: Οι αλληλουχίες των ΧΕΝ ομαδοποιούνται σε δύο μεγάλες φυλογενετικές ομάδες: την ομάδα υπότυπου CRF14_BG και την ομάδα υπότυπου CRF35_AD. Για πρώτη φορά ταυτοποιείται επιδημία με ανασυνδυασμένους υπότυπους (CRFs) στο δίκτυο των ΧΕΝ.Background: Human immunodeficiency virus (HIV), the etiologic agent of Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS), is characterized by genetic heterogeneity and is globally classified into four groups, of which group M is responsible for AIDS pandemic and is phylogenetically classified into nine subtypes, sub-subtypes and recombinant forms. Until 2010, the majority of cases of HIV-1 infection in Greece were men who have sex with men. However, during 2011, a significant increase in the number of newly diagnosed HIV-1 infections among injecting drug users (IDUs) was observed. Methods: Sixty-fiveDNA sequences from HIV-positive injecting drug users, from Asia, Europe and Africa were analyzed. Specifically, everse transcription-PCR, in house nested PCR, DNA-sequencing and phylogenetic analysis of protease (PR) and reverse-transcriptase (RT) regions were conducted. Results: An in house molecular assay for the characterization of PR and RT HIV regions was developed. Phylogenetic analysis revealed that the most prevalent subtype among IDUs is CRF14_BG (72.3%), followed by CRF35_AD (12.3%), subtype B (9.2%), subtype A (3.1%) and subtype A1 (3.1%). Conclusions: The sequences of IDUs are grouped into two major phylogenetic clusters: CRF14_BG and CRF35_AD. We identified for the first time a HIV-1 epidemic with recombinant forms in the network of IDUs.uoadl:1312559greΜελέτη του τρόπου διασποράς του ιού HIV-1 στους χρήστες ενδοφλέβιων ναρκωτικών στην Ελλάδα με μεθόδους μοριακής επιδημιολογίαςborn_digital_postgraduate_thesisΔιπλωματική ΕργασίαPostgraduate Thesis2014Μοριακή ιατρικήMolecular MedicineΜεταπτυχιακή εργασίαMaster thesisΕθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο ΑθηνώνGreek Aggregator OpenArchives.gr | National Documentation Centre (EKT)