Μπραουδάκη ΜαρίαΠαρά την αλματώδη πρόοδο που έχει επιτευχθεί στην παιδιατρική ογκολογία, δεν έχει παρατηρηθεί ανάλογη πρόοδος στους όγκους εγκεφάλου. Επίσης, μολονότι, έχει πραγματοποιηθεί πληθώρα μελετών σε εγκεφαλικά νεοπλάσματα της παιδικής ηλικίας, η μοριακή βάση τους εξακολουθεί να μην είναι πλήρως κατανοητή. Τα microRNAs συνιστούν πιθανά σημαντικά υποψήφια μόρια-κλειδιά στην καρκινογένεση των εγκεφαλικών όγκων της παιδικής ηλικίας καθώς εμπλέκονται σε μία σειρά κυτταρικών διαδικασιών. Για το λόγο αυτό, η παρούσα μελέτη επικεντρώνεται στη διερεύνηση των πιθανών διαφορών στα επίπεδα έκφρασης των miRNAs μεταξύ ασθενών και ομάδας ελέγχου με σκοπό τη χρήση των διαφορικώς εκφραζόμενων miRNAs ως δυνητικά αξιόπιστους διαγνωστικούς, προγνωστικούς και θεραπευτικούς στόχους. Το υλικό της μελέτης αποτέλεσαν παιδιά με όγκο εγκεφάλου και αποθανόντα παιδιά χωρίς εγκεφαλική νεοπλασία που χρειάστηκαν νεκροτομή. Η πειραματική προσέγγιση περιλάμβανε μικροσυστοιχίες κάλυψης 1211 miRNAs. Όλες οι πολυπαραμετρικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με το υπολογιστικό περιβάλλον MATLAB. Για την ανάλυση των διαφορικώς εκφραζόμενων miRNAs μορίων χρησιμοποιήθηκε η βιβλιογραφική βάση δεδομένων Pubgene μεταξύ άλλων, με την οποία βρέθηκαν οι συσχετίσεις των miRNAs με διάφορες παθήσεις και μοριακές λειτουργικές οντολογίες. Ως δυνητικοί δείκτες διάγνωσης και πρόγνωσης της νόσου αξιολογήθηκαν τα miR-130a και miR-943 ενώ το miR-2355-5 αναδείχτηκε ως πιθανός δείκτης έγκαιρης διάγνωσης κακοήθειας με ευνοϊκή πρόγνωση. Επιπροσθέτως, σημαντική προγνωστική αξία πιθανόν να έχουν τα miR-147, miR-409-3p, miR-487b, miR-642b miR-874, miR-769-5p, miR-1267, miR-380, miR-3936, miR-483-3, ενώ γενικευμένες θεραπευτικές προσεγγίσεις ενδέχεται να αποτελούν τα miR-373, miR-508-3p, miR-1197 και miR-218-1. Τέλος, τα miR-155, miR-130a, miR-17, miR-136, miR-22, miR-224 και miR-23a αξιολογήθηκαν ως εν δυνάμει στόχοι εξατομικευμένης θεραπείας. Συμπερασματικά, τα miRNAs δύναται να χρησιμοποιηθούν ως επιπλέον μοριακοί δείκτες διάγνωσης και πρόγνωσης της νόσου, καθώς και ως στόχοι για εξατομικευμένη θεραπεία των εγκεφαλικών νεοπλασμάτων της παιδικής ηλικίας.Αlthough, substantial experimental evidence related to the diagnosis and treatment of pediatric brain tumors has been demonstrated, the understanding of the etiology and pathogenesis of the disease remains scarce. Recent microRNA (miRNAs)-based research reveals the involvement of miRNAs in various aspects of central nervous system development and proposes that they might compose key molecules underlying oncogenesis. The current study evaluated the miRNA differential expression detected between pediatric brain tumors and normal tissue controls to characterize candidate biomarkers related to diagnosis, prognosis and therapy. Overall, 19 resected tumors from children diagnosed with brain tumor were studied. As controls, deceased children who underwent autopsy and did not present any brain malignancy were used (n=4 samples of varying localization). RNA extraction was carried out using the Trizol method, whilst miRNA extraction was performed with the mirVANA miRNA isolation kit. The experimental approach included microarrays covering 1211 miRNAs. The multiparameter analyses were performed with MATLAB. For the analysis of differentially expressed miRNA molecules, the bibliographic database Pubgene was used among others, according to which correlations were found between miRNAs and various diseases and molecular functional ontologies. As potential diagnostic and prognostic markers, miR-130a and miR-943 were evaluated, whilst miR-2355-5 emerged as a candidate biomarker for the early diagnosis of malignancies related to favorable prognosis. In addition, miR-147, miR-409-3p, miR-487b, miR-642b miR-874, miR-769-5p, miR-1267, miR-380, miR-3936 and miR- 483-3 could serve as significant prognostic markers, while miR-373, miR-508-3p, miR-1197 and miR-218-1 might be used for generalised therapeutic approaches. Finally, miR-155, miR-130a, miR-17, miR-136, miR-22, miR-224 and miR-23a were evaluated as potential targets for individualized therapy. In conclusion, deeper understanding of the aberrant miRNA expression in pediatric brain tumors might aid in the development of tumor-specific miRNA signatures, which could potentially afford promising biomarkers related to diagnosis, prognosis and patient targeted therapy.uoadl:1312573greΜελέτη των επιπέδων έκφρασης των miRNAs σε εγκεφαλικές νεοπλασίες της παιδικής ηλικίαςborn_digital_postgraduate_thesisΔιπλωματική ΕργασίαPostgraduate Thesis2014Μοριακή ιατρικήMolecular MedicineΜεταπτυχιακή εργασίαMaster thesisΕθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο ΑθηνώνGreek Aggregator OpenArchives.gr | National Documentation Centre (EKT)