Η κλωστηριδίωση προκαλείται μετά από έντονο πολλαπλασιασμό των διαφόρων ειδών κλωστηριδίων και τοξινικών τύπων τους, μέσα στον πεπτικό σωλήνα ή σε διάφορα άλλα όργανα των ζώων. Υπάρχουν αρκετοί παράγοντες που δρουν ευνοϊκά στον έντονο πολλαπλασιασμό των κλωστηριδίων ή στη διέγερση της βλάστησης των σπόρων τους.
Αναφέρονται ενδεικτικά οι κυριότεροι από αυτούς τους παράγοντες που συνδέονται με τη διατάραξη της ισορροπίας της πεπτικής μικροχλωρίδας των ζώων και όχι μονο. Έτσι, μπορούν να δρούν ευνοϊκά στον έντονο πολλαπλασιασμό των κλωστηριδίων των ζώων και να συμβάλλουν στην πρόκληση κλωστηριδιασής.