1. Αρχική σελίδα
  2. Αναζήτηση

DIANA-microT web server: Elucidating microRNA functions through target prediction

Το τεκμήριο παρέχεται από τον φορέα :
Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο   

Αποθετήριο :
Ψηφιακό Αποθετήριο της Κεντρικής Βιβλιοθήκης του ΕΜΠ | Dspace@NTUA   

δείτε την πρωτότυπη σελίδα τεκμηρίου
στον ιστότοπο του αποθετηρίου του φορέα για περισσότερες πληροφορίες και για να δείτε όλα τα ψηφιακά αρχεία του τεκμηρίου*



DIANA-microT web server: Elucidating microRNA functions through target prediction (EN)
Simossis, VA (EN)
Dalamagas, T (EN)
Koziris, N (EN)
Tsanakas, P (EN)
Goumas, G (EN)
Maragkakis, M (EN)
Sellis, T (EN)
Alexiou, P (EN)
Hatzigeorgiou, AG (EN)
Kourtis, K (EN)
Koukis, E (EN)
Reczko, M (EN)
Giannopoulos, G (EN)
Vergoulis, T (EN)
Papadopoulos, GL (EN)
journalArticle (EN)
2014-03-01T01:30:11Z
2009 (EN)
Computational microRNA (miRNA) target prediction is one of the key means for deciphering the role of miRNAs in development and disease. Here, we present the DIANA-microT web server as the user interface to the DIANA-microT 3.0 miRNA target prediction algorithm. The web server provides extensive information for predicted miRNA: target gene interactions with a user-friendly interface, providing extensive connectivity to online biological resources. Target gene and miRNA functions may be elucidated through automated bibliographic searches and functional information is accessible through Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathways. The web server offers links to nomenclature, sequence and protein databases, and users are facilitated by being able to search for targeted genes using different nomenclatures or functional features, such as the genes possible involvement in biological pathways. The target prediction algorithm supports parameters calculated individually for each miRNA: target gene interaction and provides a signal-to-noise ratio and a precision score that helps in the evaluation of the significance of the predicted results. Using a set of miRNA targets recently identified through the pSILAC method, the performance of several computational target prediction programs was assessed. DIANA-microT 3.0 achieved there with 66% the highest ratio of correctly predicted targets over all predicted targets. The DIANA-microT web server is freely available at www.microrna.gr/microT. (EN)
Biochemistry & Molecular Biology (EN)
User-Computer Interface (EN)
web browser (EN)
accuracy (EN)
client server application (EN)
genetic database (EN)
computer interface (EN)
nomenclature (EN)
microrna (EN)
gene interaction (EN)
performance measurement system (EN)
priority journal (EN)
Binding Sites (EN)
computer prediction (EN)
algorithm (EN)
search engine (EN)
gene sequence (EN)
signal noise ratio (EN)
User Interface (EN)
Gene Expression Regulation (EN)
Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (EN)
gene targeting (EN)
gene function (EN)
Signal To Noise Ratio (EN)
article (EN)
Algorithms (EN)
Sequence Analysis, RNA (EN)
MicroRNAs (EN)
microRNA (EN)
Software (EN)
online system (EN)
RNA, Messenger (EN)
Nucleic Acids Research (EN)
Αγγλική γλώσσα
OXFORD UNIV PRESS (EN)
Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο
Ψηφιακό Αποθετήριο της Κεντρικής Βιβλιοθήκης του ΕΜΠ | Dspace@NTUA
Κεντρική Βιβλιοθήκη Ε.Μ.Π.
Ιδρυματικό Αποθετήριο
Δημοσιεύσεις μελών Δ.Ε.Π. σε περιοδικά



*Η εύρυθμη και αδιάλειπτη λειτουργία των διαδικτυακών διευθύνσεων των συλλογών (ψηφιακό αρχείο, καρτέλα τεκμηρίου στο αποθετήριο) είναι αποκλειστική ευθύνη των αντίστοιχων Φορέων περιεχομένου.