Μερικά λοιμώδη νοσήματα των αμνοεριφίων ηλικίας ολίγων ημερών, εκδηλώνονται με διάρροια. Στην οξεία φάση των νοσημάτων αυτών η διάρροια οδηγεί ταχύτατα σε αφυδάτωση ή και σε θάνατο μέσα σε διάστημα ολίγων μόνο ωρών. Στις πιο χρόνιες μορφές η διάρροια επιμένει για μερικές ημέρες και οδηγεί τα ζώα σε υποσιτισμό και απίσχνανση. Το παραπάνω διαρροϊκό σύνδρομο δημιουργείται από τον πολλαπλασιασμό και τις τοξίνες μικροοργανισμών που προκαλούν φλεγμονή και καταστρέφουν το εντερικό επιθήλιο επιφέροντας διαταραχές στην απορρόφηση των συστατικών της τροφής (γάλακτος). Για να εκδηλωθεί το παραπάνω σύνδρομο φαίνεται ότι εκτός από τους μικροοργανισμούς, ρόλο παίζουν η έλλειψη ανοσίας στα νεογέννητα καθώς και οι παράγοντες του περιβάλλοντος (υγιεινή, σύστημα ενσταυλισμού, αντίξοες καιρικές συνθήκες κατά την περίοδο των τοκετών, κ.τ.λ.). Οι μικροοργανισμοί που ενοχοποιούνται περισσότερο στο διαρροϊκό σύνδρομο των νεογέννητων αμνοεριφίων φαίνεται ότι είναι το κολοβακτηρίδιο (Escherichia coli), το κρυπτοσπορίδιο (Cryptosporidium parvum) και οι ροτα και κορονα – ιοί (rota and corona viruses).