"Black heart" or "heart rot" disease of pomegranate fruit, related to the
genus Alternaria, has been reported causing significant qualitative and quantitative
crop losses worldwide. The scope of the present study was the species identification
of the Alternaria species involved in the "black heart" of pomegranates in Greece and
Cyprus. Thus, during 2013, local orchards were surveyed and 82 fungal isolates of the
genus Alternaria from Greece and Cyprus were collected from pomegranates
expressing preharvest rot symptoms. Partial sequencing of the endopolygalacturonase
(EndoPG) gene using the primers PG3 and PG2b, revealed that
preharvest Alternaria pomegranate fruit rots were caused by the species Alternaria
alternata, A. tenuissima, and A. arborescens. More specifically, 30 isolates
were A.alternata, 19 A. tenuissima and 14 A. arborescens. The remaining 19 isolates
were found to belong to the complex A. alternata/A. tenuissima and an accurate
separation at the species level was not possible. In order to fulfill full identification
the remaining isolates were characterized based on morphological characteristics and
more specifically on their sporulation patterns. The combinatorial identification
approach followed herein revealed that the predominant Alternaria species related to
the 'black heart" of pomegranates was A. alternata with frequencies of 50 and 55.9%
in Greece and Cyprus, respectively. The species A. tenuissima and A.
arborescens followed at frequencies of 31.2% and 29.4% and 18.8% and 14.7% in
Greece and Cyprus, respectively.
Μύκητες του γένους Alternaria έχουν αναφερθεί ως παθογόνα αίτια σήψεων σε
καρπούς ροδιάς. Πιο συγκεκριμένα αναφέρεται ότι είδη του γένους Alternaria είναι
υπεύθυνα για την ασθένεια της «μαύρης καρδιάς» ή «σήψης της καρδιάς» με
εξαιρετικά δυσμενείς επιπτώσεις στην ποσότητα και την ποιότητα της
συγκομιζόμενης παραγωγής. Σκοπός της εργασίας ήταν ο χαρακτηρισμός ειδών
Alternaria που εμπλέκονται στην ασθένεια της «μαύρης καρδιάς» της ροδιάς στην
Ελλάδα και την Κύπρο. Μελετήθηκαν 82 απομονώσεις του γένους Alternaria που
απομονώθηκαν την περίοδο Αυγούστου - Σεπτεμβρίου του 2013 από τις δυο χώρες.
Αρχικά η ταυτοποίηση πραγματοποιήθηκε μοριακά, μέσω της ενίσχυσης και
αλληλούχισης του γονιδίου της ενδο-πολυγαλακτουρονάσης (EndoPG)
χρησιμοποιώντας τους εκκινητές PG3 και PG2b. Τα αποτελέσματα κατέδειξαν ότι 30
απομονώσεις ήταν Alternaria alternata, 19 A. tenuissima και 14 A. αrborescens, ενώ
για τις υπόλοιπες 19 βρέθηκε ότι ανήκουν στο σύμπλοκο A. alternata/A. tenuissima
χωρίς να είναι δυνατός ο ακριβής διαχωρισμός τους σε επίπεδο είδους. Λόγω
αδυναμίας πλήρους ταυτοποίησης μέσω της μοριακής μεθόδου, ακολουθήθηκε
μορφολογική ταυτοποίηση των εναπομείναντων απομονώσεων με βάση τα
χαρακτηριστικά σποριοποίησης τους. Η συνδυαστική προσέγγιση ταυτοποίησης
έδειξε ότι το κυρίαρχο είδος που σχετίζεται με την ασθένεια της «μαύρης καρδιάς»
στην Ελλάδα και στη Κύπρο ήταν το Alternaria alternata με συχνότητες 50 και
55.9% αντίστοιχα. Τα είδη A. tenuissima και A. arborescens ακολούθησαν σε
συχνότητες 31.2% και 29.4% και 18.8% και 14.7% σε Ελλάδα και Κύπρο αντίστοιχα.
Agricultural and Veterinary Sciences ▶ Agriculture, Forestry and Fisheries Agriculture, general
(EN)
Agricultural and Veterinary Sciences ▶ Agricultural Biotechnology Food Biotechnology
(EN)
Τμήμα Γεωπονικών Επιστημών, Βιοτεχνολογίας και Επιστήμης Τροφίμων, Σχολή Γεωτεχνικών Επιστημών και Διαχείρισης Περιβάλλοντος, Τεχνολογικό Πανεπιστήμιο Κύπρου
Department of Agricultural Sciences, Biotechnology and Food Science
Faculty of Geotechnical Science and Environmental Management
Cyprus University of Technology
