Πρωτεωμική ανάλυση των τμημάτων οσφρητικοί βολβοί, ιππόκαμπος, μεσεγκέφαλος και φλοιός του εγκεφάλου μυός C57BL/6

This item is provided by the institution :
/aggregator-openarchives/portal/institutions/uoa   

Repository :
Pergamos Digital Library   

see the original item page
in the repository's web site and access all digital files if the item*



Πρωτεωμική ανάλυση των τμημάτων οσφρητικοί βολβοί, ιππόκαμπος, μεσεγκέφαλος και φλοιός του εγκεφάλου μυός C57BL/6

Ταρασλιά Βασιλική (EL)

born_digital_postgraduate_thesis
Διπλωματική Εργασία (EL)
Postgraduate Thesis (EN)

2011


Στην παρούσα εργασία με μεθόδους πρωτεωμικής αναλύθηκε εις βάθος εγκέφαλος φυσιολογικού μυός. Ενήλικοι μύες 12 εβδομάδων θανατώθηκαν και ο εγκέφαλος χωρίστηκε ανατομικά και απομονώθηκαν τα τμήματα: οσφρητικοί βολβοί, μεσεγκέφαλος, φλοιός και ιππόκαμπος. Η ανάλυση των πρωτεϊνών έγινε με ηλεκτροφόρηση δύο διαστάσεων. Η πρώτη διάσταση έγινε σε ταινίες ισοηλεκτρικού σημείου 3-10 και 4-7 και η δεύτερη διάσταση σε πήκτωμα ακρυλαμίδης 12% το οποίο βάφτηκε με Κυανού της Κουμασίνης. Οι εικόνες των πηκτωμάτων ανά περιοχή εγκεφάλου επεξεργάστηκαν με χρήση του λογισμικού PD Quest. Όλες οι κηλίδες αποκόπηκαν από τα πηκτώματα με τη χρήση ειδικού μηχανικού ρομπότ και επωάστηκαν με τρυψίνη. Τα παραγόμενα πεπτίδια αναλύθηκαν με MALDI-TOF/MS και η ταυτοποίηση των πρωτεϊνών έγινε με τη χρήση του προγράμματος Mascot. Με τη διαδικασία αυτή ταυτοποιήθηκαν συνολικά 1.640 πρωτεΐνες, ενώ ως διαφορετικά μονογονιδιακά προϊόντα (single gene products) αναγνωρίστηκαν συνολικά στα τμήματα που μελετήθηκαν 512 διαφορετικές πρωτεΐνες, και 165 από αυτές τις πρωτεΐνες εκφράζονται σε όλα τα τμήματα που αναλύθηκαν. (EL)
In the present study normal mouse brain was analyzed using proteomic methods. Adult mice, 12 weeks old, were sacrificed and the brain parts were separated anatomically to the following regions: cortex, olfactory bulb, hippocampus, midbrain and medulla. Protein analysis of these regions was conducted by two dimensional gel electrophoresis. For the first dimension IPG strips of pI 3-10 and 4-7 were used and the second dimension was performed in 12% acrylamide gel, followed by Coomasie Blue stain. PD Quest software was used to analyze the gel images per region. All the spots were excised from the gels using a specific robot and incubated with trypsin. The peptides were processed with MALDI TOF/MS and the protein identification was carried out using the Mascot software. Thus, 1.640 different single gene products were identified and 512 different proteins were detected totally, whereas 165 of them were found to be expressed at every analyzed brain part. (EN)


Greek

Βιβλιοθήκη και Κέντρο Πληροφόρησης » Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Σχολή Θετικών Επιστημών » Τμήμα Βιολογίας » Τομέας Βιολογίας Κυττάρου Και Βιοφυσικής

https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/




*Institutions are responsible for keeping their URLs functional (digital file, item page in repository site)