1. Home page
  2. Search

Ανάπτυξη και επικύρωση μεθοδολογίας ανίχνευσης αναπνευστικών ιών σε αστικά λύματα με RT-qPCR

This item is provided by the institution :
/aggregator-openarchives/portal/institutions/uoa   

Repository :
Pergamos Digital Library   

see the original item page
in the repository's web site and access all digital files if the item*



Ανάπτυξη και επικύρωση μεθοδολογίας ανίχνευσης αναπνευστικών ιών σε αστικά λύματα με RT-qPCR
Καλτσής Λάζαρος (EL)
Kaltsis Lazaros (EN)
born_digital_postgraduate_thesis
Διπλωματική Εργασία (EL)
Postgraduate Thesis (EN)
2023
Η Επιδημιολογία Λυμάτων αποτελεί αρωγό στη παροχή χρήσιμων πληροφοριών για τη διασπορά παθογόνων οργανισμών και την έξαρση αυτών μέσα σε ένα πληθυσμό. Είναι ένα χημικό, μη παρεμβατικό και οικονομικό εργαλείο με το οποίο δύναται να ελεγχθεί ο επιπολασμός νόσων και ο ο μετέπειτα περιορισμός τις εξάπλωσης τους στην σε μία κοινότητα. Η εφαρμογή της, αντικατοπτρίζει την επικρατούσα τάση του ιικού φορτίου και δίνει πληροφορίες για τη Δημόσια Υγεία στις Αρμόδιες Αρχές με απώτερο σκοπό την έγκαιρη προειδοποίηση για την αποφυγή μεγαλύτερου βεληνεκούς έξαρσης στην κοινότητα. Η ανίχνευση και ταυτοποίηση των αναπνευστικών ιών στα αστικά λύματα αποτελή σύνθετη και πολύπλοκη διαδικασία λόγω της πολυπλοκότητας του μητρικού υλικού, της μειωμένης σταθερότητας του ιικού RNA στα συστήματα αποχέτευσης και των χαμηλών ανακτήσεων του ιικού φορτίου. Στην παρούσα διπλωματική εργασία πραγματοποιήθηκε ανάπτυξη και επικύρωση μεθόδου RT-qPCR για την ανίχνευση του RSV ενώ παράλληλα έγινε και επικυρώση του αναλύτικου πρωτοκόλλου που χρήσιμοποιείται για την ανίχνευση των ιών της γρίπης (A & B). Τέλος, τα βελτιστοποιημένα και επικυρωμένα πρωτόκολλα ανίχνευσης των εν λόγω ιών εφαρμόστηκαν σε μια σειρά δειγμάτων από τα αστικά λύματα και έγινε σχολιασμός και επεξεργασία αυτών των αποτελεσμάτων. (EL)
Wastewater-based Epidemiology offers a variety of information about the pathogen spread and their outbreak within a population. It is a chemical, cost-effective and non-invasive tool which provides information about the prevalence of diseases in a population. By implementating this tool, information about the prevalent trend of the viral load can be received and a valid warning can be given to the Competend Authorities about the public health. However, the identification and therefore, the detection of the respiratory viruses is a complicated process due to the complexity of the matrix, the lack of RNA stability in the sewage system and the low levels of recovery of the viral load. The aim of this present thesis is the development of a method for the detection and identification of respiratory viruses, such as Influenza virus A and B and RSV virus, in wastewater samples. Specifically, the analytical method consists of 3 main steps, which are the preconcentration of the samples, the RNA purification and extraction and the measurement with the RT-qPCR method. Subsequently, a validation of the selected analytical protocols for the Influenza A & B an RSV virus was performed, the steps for the report of the quality control of the method are presented and the validated detection assays were used to detect the viral load in daily wastewater samples. (EN)
Θετικές Επιστήμες
Θετικές Επιστήμες (EL)
Science (EN)
Greek
Σχολή Θετικών Επιστημών » Τμήμα Χημείας » ΠΜΣ Αναλυτική Χημεία-Διασφάλιση ποιότητας » Κατεύθυνση Αναλυτική Χημεία-Διασφάλιση ποιότητας
Βιβλιοθήκη και Κέντρο Πληροφόρησης » Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
University of Athens
Pergamos Digital Library
Postgraduate Thesis



*Institutions are responsible for keeping their URLs functional (digital file, item page in repository site)