Απομόνωση δευτερογενών μεταβολιτών με αντιμικροβιακή δράση από θαλάσσιους οργανισμούς προερχόμενους από μεγάλα βάθη

This item is provided by the institution :
/aggregator-openarchives/portal/institutions/uoa   

Repository :
Πέργαμος   

see the original item page
in the repository's web site and access all digital files if the item*



Απομόνωση δευτερογενών μεταβολιτών με αντιμικροβιακή δράση από θαλάσσιους οργανισμούς προερχόμενους από μεγάλα βάθη

Περδικάρης Σταμάτιος (EL)

born_digital_thesis
Διδακτορική Διατριβή (EL)
Doctoral Dissertation (EN)

2015


Οι θαλάσσιοι οργανισμοί αποτελούν μία ανεξάντλητη πηγή δευτερογενών μεταβολιτών με ιδιαίτερες χημικές δομές και ενδιαφέροντες οικολογικούς ρόλους, οι οποίοι παράλληλα παρουσιάζουν ευρύ φάσμα βιολογικών δράσεων συχνά μέσω εξειδικευμένων μηχανισμών. Μέχρι σήμερα, αρκετά μόρια προερχόμενα από θαλάσσιους οργανισμούς αποτελούν τη δραστική ουσία φαρμακευτικών σκευασμάτων, ενώ πολλά ακόμη βρίσκονται σε διάφορα στάδια προκλινικών και κλινικών δοκιμών. Πέρα από το φαρμακολογικό ενδιαφέρον, τα θαλάσσια φυσικά προϊόντα βρίσκουν εφαρμογή και σε άλλα πεδία, όπως στην τεχνολογία υλικών, στην κοσμητολόγια, αλλά και στην αντιμετώπιση της βιοεπίστρωσης. Το θαλάσσιο περιβάλλον αποτελεί ένα πολύπλοκο οικοσύστημα, το οποίο στο μεγαλύτερο μέρος του δεν έχει εξερευνηθεί, ειδικά οι περιοχές και οι οργανισμοί που αναπτύσσονται σε μεγάλα βάθη, καθώς μόλις τις τελευταίες δεκαετίες υλοποιήθηκαν τα τεχνολογικά επιτεύγματα που επιτρέπουν την ασφαλή πρόσβαση σε αντίστοιχες απαιτητικές συνθήκες. Αντικείμενο της παρούσας διδακτορικής διατριβής είναι η μελέτη της χημικής σύστασης θαλάσσιων οργανισμών από μεγάλα βάθη με σκοπό την απομόνωση και ταυτοποίηση νέων φυσικών προϊόντων, ώστε στην συνέχεια να υποβληθούν σε αξιολόγηση της βιοδραστικότητας τους. Ποσότητες από έξι θαλάσσιους οργανισμούς συλλέχθηκαν από διάφορες περιοχές των Ελληνικών θαλασσών, εκχυλίστηκαν εξαντλητικά και υποβλήθηκαν σε σειρά χρωματογραφικών διαχωρισμών με σκοπό την απομόνωση των δευτερογενών μεταβολιτών τους. Η ταυτοποίηση της δομής τους βασίσθηκε στην ανάλυση των φασματοσκοπικών τους δεδομένων (NMR, MS, IR, UV). Συνολικά, απομονώθηκαν και ταυτοποιήθηκαν 69 δευτερογενείς μεταβολίτες, εκ των οποίων οι 18 αποτελούν νέα φυσικά προϊόντα. Aπό τον σπόγγο Ciocalypta sp. που συλλέχθηκε από τη θαλάσσια περιοχή της Σαντορίνης με βαθυσκάφος σε βάθος 230 m απομονώθηκε ένας σπάνιος δευτερογενής μεταβολίτης στεροειδούς δομής που φέρει τρεις θειϊκές ομάδες. Aπό τον σπόγγο Aplysina cavernicola που συλλέχθηκε από την περιοχή της Κυλλήνης σε βάθος 100-120 m απομονώθηκαν τα διτερπένια trans-κομμουνικό οξύ , δεϋδροαβιετικό οξύ και ισοπιμαρικό οξύ, τα οποία αναφέρονται πρώτη φορά ως συστατικά θαλάσσιων οργανισμών. Από το μαλακό κοράλλι Paramuricea clavata που συλλέχθηκε από τη θαλάσσια περιοχή της Σάμου σε βάθος 80-100 m απομονώθηκαν τρεις δευτερογενείς μεταβολίτες, και συγκεκριμένα ένα xv αζουλένιο και το διμερές του, που αποτελεί νέο φυσικό προϊόν, καθώς και το γνωστό στεροειδές χολεστ-5-εν-3β-19-διόλη. Από το ροδοφύκος Vidalia volubilis που συλλέχθηκε από τον Κορινθιακό κόλπο στην περιοχή του Πόρτο Γερμενό σε βάθος 25-40 m απομονώθηκαν τα γνωστά στεροειδή 24(28)-μεθυλενο-χοληστερόλη και χοληστερόλη. Από το ροδοφύκος Laurencia microcladia που συλλέχθηκε με αυτόνομη κατάδυση (SCUBA) στην Ζάκυνθο (10-15 m) απομονώθηκαν 25 δευτερογενείς μεταβολίτες. Οι δεκατέσσερις εξ αυτών ταυτοποίηθηκαν ως C15 ακετογενίνες, εκ των οποίων οκτώ αποτελούν νέα φυσικά προϊόντα με σκελετό λαουρενανίου. Οι πέντε ταυτοποίηθηκαν ως γνωστές C15 ακετογενίνες με σκελετό λαουρενανίου, ενώ μία ταυτοποιήθηκε ως γνωστή C15 ακετογενίνη με σκελετό λαουθισανίου. Επιπρόσθετα, ταυτοποίηθηκαν επτά σεσκιτερπένια εκ των οποίων, τρία με σκελετό μπρασιλανίου, ένα με σκελετό πρεσιλπερφολιανίου, ένα με σκελετό κυκλοοκτενοειδούς ένα με σκελετό χουμουλενίου και ένα με σκελετό σνυδερανίου. Τέλος, ταυτοποίηθηκαν δύο διτερπένια σκελετού φυτανίου, μία αλογονωμένη αλειφατική αλδεϋδη και ένα απλό φαινολικό παράγωγο. Από το ροδοφύκος Laurencia obtusa που συλλέχθηκε με αυτόνομη κατάδυση (SCUBA) στη Λευκάδα (10-20 m) απομονώθηκαν 35 δευτερογενείς μεταβολίτες. Οι δεκαπέντε εξ αυτών ταυτοποίηθηκαν ως σεσκιτερπένια, εκ των οποίων τρία αποτελούν νέα φυσικά προϊόντα με σκελετό κουπαρενίου. Δύο μεταβολίτες ταυτοποίηθηκαν ως σεσκιτερπένια της ίδιας κατηγορίας, τέσσερις με σκελετού τσαμιγκρανίου, πέντε με σκελετό λαουρενίου και ένας ως αλογονωμένο σεσκιτερπένιο. Οι υπόλοιποι είκοσι δευτερογενείς μεταβολίτες ταυτοποιήθηκαν ως C15 ακετογενίνες, εκ των οποίων έξι αποτελούν νέα φυσικά προϊόντα με σκελετό ομπτουσαλλενίου. Επτά μεταβολίτες ταυτοποίηθηκαν ως C15 ακετογενίνες της ίδιας κατηγορίας, δύο ως γραμμικές C15 ακετογενίνες, τέσσερις ως C15 ακετογενίνες με οκταμελή αιθερικό δακτύλιο και μία με εννιαμελή. (EL)
Marine organisms constitute an inexhaustible source of secondary metabolites characterized by intriguing chemical structures, interesting ecological roles and a wide range of biological activities frequently manifesting unique mechanisms of action. Up to now, several marine metabolites have been used as the active ingredients in pharmaceutical drugs, while an even greater number is currently being tested in pre-clinical and clinical trials. Further to their pharmacological potential, marine natural products find applications in other fields, such as cosmetology, material science, and prevention of biofouling. The marine environment constitutes a complicated ecosystem that is only superficially investigated, especially at its deepest parts. The recent technological achievements allow safer investigation of these extreme environments, opening new frontiers. The subject of the present study was the investigation of the chemical profile of deep sea marine organisms targeting the isolation and structure elucidation of new bioactive natural products. Six marine organisms (Ciocalypta sp., Aplysina cavernicola, Paramuricea clavata, Vidalia volubilis, Laurencia microcladia, Laurencia obtusa) were collected either by a submersible, dredging or SCUBA diving from different sites along the Greek Seas and their organic extracts were investigated for the isolation/structure elucidation of their secondary metabolites. In total, sixty nine metabolites were isolated and their structures were elucidated based on interpretation of their spectroscopic data. Among the isolated metabolites eighteen were found to be new natural products. Α rare highly sulfated steroid was isolated as the main constituent of the sponge Ciocalypta sp. collected by a deep water submersible from the underwater volcanic area of Santorini island at a depth of 230 m. The three known diterpenes trans-communic acid, dehydroabietic acid and isopimaric acid were isolated from the sponge Aplysina cavernicola collected from Killini bay at depths ranging from 100 to 120 m. The aforementioned metabolites are reported for the first time as constituents of marine organisms. The previously reported linderazulene, its dimer identified as a new natural product and the known steroid cholest-5-en-3β-19-diol were isolated from the soft coral Paramuricea clavata collected from Samos island at depths of 80-100 m. The common steroids 24(28)-methylene-cholesterol and cholesterol were isolated from the red alga Vidalia volubilis collected by dredging from the Corinthian gulf (Porto Germeno) at depths of 25-40 m. Twenty five secondary metabolites were isolated from the organic extract of the red alga Laurencia microcladia collected by SCUBA diving at depths of 10-15 m from the rocky coasts of Zakynthos island. Fourteen of the isolated metabolites were identified as laurenane and lauthisane C15 acetogenins. Among the thirteen C15 acetogenins bearing the laurenane skeleton, eight were new natural products. Furthermore, seven sesquiterpenes including representatives of brasilanes, presilphiperfolanes, cyclooctenoids, humulenes and snyderanes were isolated. Additionally, two diterpenes with phytane skeleton, along with one halogenated aliphatic aldehyde and one simple phenolic compound were found as constituents of the same extract. Chemical investigation of the red alga Laurencia obtusa collected from the coastline of Lefkas island by SCUBA diving at depths of 10-20 m yielded thirty five secondary metabolites identified either as sesquiterpenes or C15 acetogenins. Among the fifteen sesquiterpenes isolated, five metabolites, including three new natural products, belong to the class of cuparanes, four metabolites featured the chamigrane skeleton, five metabolites possessed a laurane carbocycle and one metabolite was a halogenated sesquiterpene. The C15 acetogenins of L. obtusa were comprised of thirteen obtusallene type metabolites, including six new natural products, two linear C15 acetogenins, four C15 acetogenins bearing an eight membered ether ring and one metabolite bearing a nine membered ether ring. The evaluation of the biological activities of the isolated metabolites is currently under investigation. (EN)


Greek

Σχολή Θετικών Επιστημών » Τμήμα Φαρμακευτικής » Τομέας ΦΑΡΜΑΚΟΓΝΩΣΙΑΣ ΚΑΙ ΧΗΜΕΙΑΣ ΦΥΣΙΚΩΝ ΠΡΟΪΟΝΤΩΝ
Βιβλιοθήκη και Κέντρο Πληροφόρησης » Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών

https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/




*Institutions are responsible for keeping their URLs functional (digital file, item page in repository site)