Μελέτη της έκφρασης και ενεργότητας της L-Dopa αποκαρβοξυλάσης σε ανθρώπινα κύτταρα

This item is provided by the institution :
/aggregator-openarchives/portal/institutions/uoa   

Repository :
Pergamos Digital Library   

see the original item page
in the repository's web site and access all digital files if the item*



Μελέτη της έκφρασης και ενεργότητας της L-Dopa αποκαρβοξυλάσης σε ανθρώπινα κύτταρα

Κοκκίνου Ιωάννα (EL)

born_digital_thesis
Διδακτορική Διατριβή (EL)
Doctoral Dissertation (EN)

2012


Η L-3,4 διυδροξυ-φαινυλ-αλανίνη αποκαρβοξυλάση (L-Dopa αποκαρβοξυλάση, L-Dopa decarboxylase ή DDC, EC 4.1.1.26) είναι το ένζυμο το οποίο καταλύει την αποκαρβοξυλίωση της L-Dopa σε ντοπαμίνη. Η ντοπαμίνη αποτελεί έναν από τους σημαντικότερους διαμεσολαβητές της επικοινωνίας μεταξύ νευρικού και ανοσοποιητικού συστήματος δεδομένου ότι αποτελεί ρυθμιστικό παράγοντα του πολλαπλασιασμού και της διαφοροποίησης διαφόρων υποτύπων λευκών αιμοσφαιρίων. Τα λευκά αιμοσφαίρια αλληλεπιδρούν με την ντοπαμίνη όταν, μετά από ενεργοποίηση τους, διαπερνούν τον αιματοεγκεφαλικό φραγμό, αλλά και στην περιφέρεια, καθώς τα λευκά αιμοσφαίρια έχουν την ικανότητα ενδογενούς σύνθεσης, έκκρισης και πρόσληψης των κατεχολαμινών. Η ντοπαμίνη ασκεί τη ρυθμιστική της δράση μέσω των υποδοχέων ντοπαμίνης που εντοπίζονται στην πλασματική μεμβράνη των λευκών αιμοσφαιρίων. Παρότι πολλαπλά πειραματικά δεδομένα υποδεικνύουν την επικοινωνία μεταξύ νευρικού και ανοσοποιητικού συστήματος, το μονοπάτι βιοσύνθεσης κατεχολαμινών στα λευκά αιμοσφαίρια, δεν έχει πλήρως διαλευκανθεί. Επιπρόσθετα, τα δεδομένα που αφορούν τη ρυθμιστική δράση της ντοπαμίνης παρουσιάζονται αντιφατικά. Η ανάγκη να διερευνηθεί περαιτέρω η δράση της ντοπαμίνης στις λειτουργίες του ανοσοποιητικού συστήματος ενισχύεται από δεδομένα σύμφωνα με τα οποία μερικές από τις πιο σημαντικές νευροεκφυλιστικές ασθένειες, όπως η νόσος του Parkinson και η σχιζοφρένεια έχουν συσχετιστεί με δυσλειτουργίες του ανοσοποιητικού συστήματος. Συνεπώς, η πλήρης αποσαφήνιση των βιοχημικών μονοπατιών στα οποία εμπλέκεται η ντοπαμίνη στο ανοσοποιητικό σύστημα μπορεί να βοηθήσει στην κατανόηση της παθογένεσης και στη θεραπεία πολλών νευροεκφυλιστικών ασθενειών. Βάσει των ανώτερων δεδομένων καθώς και πρόσφατων μελετών στο εργαστήριο μας οι οποίες αποκάλυψαν για πρώτη φορά την έκφραση της πλήρους μήκους DDC και του εναλλακτικού μεταγράφου από το οποίο απουσιάζει το εξώνιο 3 σε ανθρώπινα περιφερικά λευκά αιμοσφαίρια, σκοπός της παρούσας διατριβής ήταν η περαιτέρω διερεύνηση της έκφρασης, της υποκυτταρικής κατανομής, της ενζυμικής ενεργότητας της DDC αλλά και της ρύθμισης της σε κύτταρα του ανοσοποιητικού συστήματος του ανθρώπου. Τα αποτελέσματα της διατριβής συνοψίζονται στις παρακάτω τρείς ενότητες: • Μελέτη έκφρασης, τοπολογίας και ενζυμικής ενεργότητας της DDC στα ανθρώπινα περιφερικά λευκά αιμοσφαίρια Με σκοπό τη μελέτη της υποκυτταρικής κατανομής της DDC στα ανθρώπινα περιφερικά λευκά αιμοσφαίρια, δείγματα ομογενοποιήματος λευκών αιμοσφαιρίων επεξεργάστηκαν με το μη ιονικό απορρυπαντικό Triton X-114. Το ένζυμο εντοπίστηκε τόσο στο υδρόφιλο κλάσμα όσο και στο υδρόφοβο και ισχυρά υδρόφοβο ίζημα υποδηλώνοντας το συσχετισμό του μορίου με το μεμβρανικό κλάσμα και την ύπαρξη πληθυσμών με διαφορετικό βαθμό υδροφοβικότητας στα λευκά αιμοσφαίρια. Με πειράματα ανοσοστύπωσης κατά Western ανιχνεύτηκε η εναλλακτική ισομορφή της DDC, alt-DDC. Σε πειράματα μέτρησης ενεργότητας του ενζύμου σε ομογενοποίημα λευκών αιμοσφαιρίων η DDC εμφανίζεται ενεργή ως προς την αποκαρβοξυλίωση της L-Dopa (mU/mg = 3,67 ± 0,31). Αν και τα επίπεδα ενεργότητας της DDC στα λευκά αιμοσφαίρια είναι χαμηλότερα σε σχέση με τα επίπεδα ενεργότητας της DDC νεφρού ανθρώπου, τα παραπάνω αποτελέσματα υποδεικνύουν ότι η DDC των λευκών αιμοσφαιρίων προέρχεται όχι μόνο μέσω πρόσληψης από το μεσοκυττάριο υγρό αλλά και μέσω ενδογενούς σύνθεσης της στον κυτταρικό αυτό πληθυσμό. • Μελέτη έκφρασης, τοπολογίας και ενζυμικής ενεργότητας της DDC στην κυτταρική σειρά U937 Προκειμένου να διερευνηθεί περαιτέρω η έκφραση, η τοπολογία και η ενζυμική ενεργότητα της DDC στα κύτταρα του ανοσοποιητικού συστήματος, χρησιμοποιήθηκε η κυτταρική σειρά U937. Πρόκειται για ανθρώπινα μονοκύτταρα προέλευσης μακροφάγων τα οποία χρησιμοποιούνται ευρέως ως μοντέλο λειτουργίας μακροφάγων. Με πειράματα ανοσοστύπωσης κατά Western, η DDC ανιχνεύεται για πρώτη φορά στην κυτταρική σειρά U937. Διερεύνηση της φύσης των μεταγράφων που παράγονται στον υπό μελέτη κυτταρικό τύπο με αντιδράσεις αντίστροφης μεταγραφής-αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης και περαιτέρω πειράματα ανοσοστύπωσης κατά Western υποδεικνύουν ότι στην κυτταρική σειρά U937 παράγονται η alt-DDC και το νευρικού τύπου μετάγραφο από το οποίο απουσιάζει το εξώνιο 3. Το πλήρους μήκους μετάγραφο, καθώς και μη νευρικού τύπου μετάγραφο δεν ανιχνεύονται. Η υποκυτταρική κατανομή της DDC στην κυτταρική σειρά U937 διερευνήθηκε με τη χρήση του αντιδραστηρίου Triton X-114. Η επεξεργασία των δειγμάτων με το μη ιοντικό απορρυπαντικό είχε ως αποτέλεσμα την ανάκτηση της DDC στο υδρόφιλο, υδρόφοβο, αλλά και στο ισχυρά υδρόφοβο κλάσμα, υποδεικνύοντας το συσχετισμό του ενζύμου με τις μεμβράνες της κυτταρικής σειράς. Η DDC που συνδέεται με τις μεμβράνες απελευθερώνεται στο υπερκείμενο με απλή επώαση. Η απελευθέρωση φαίνεται να είναι pH εξαρτώμενη και οι βέλτιστες συνθήκες απελευθέρωσης εμφανίζονται στο pH 6-6,5. Προσδιορισμός της ενεργότητας του ενζύμου σε ολικό ομογενοποίημα, στο διαλυτό και στο μεμβρανικό κλάσμα των υπό μελέτη κυττάρων υποδηλώνει ότι η DDC είναι ενζυμικά ενεργή ως προς την αποκαρβοξυλίωση της L-Dopa σε ντοπαμίνη σε όλα τα υποκυτταρικά κλάσματα της κυτταρικής σειράς. Τα επίπεδα ενζυμικής ενεργότητας του μορίου στο μεμβρανικό κλάσμα προσδιορίζονται κατά 70% υψηλότερα σε σχέση τις τιμές ενεργότητας σε ολικό ομογενοποίημα και στο διαλυτό κλάσμα της κυτταρικής σειράς U937. Η DDC που απελευθερώνεται από το μεμβρανικό κλάσμα εμφανίζεται ενζυμικά ενεργή παρουσιάζοντας τη μέγιστη τιμή ενεργότητας όταν η απελευθέρωση πραγματοποιείται σε pH 6-6,5. Επώαση σταθερής ποσότητας πρωτεϊνών μεμβρανικού κλάσματος παρουσία αυξανόμενων ποσοτήτων ολικής πρωτεΐνης διαλυτού κλάσματος είχε ως αποτέλεσμα την μείωση της ενζυμικής ενεργότητας της DDC παρέχοντας ενδείξεις για την πιθανή ύπ αρξη κάποιου ρυθμιστικού μορίου της ενζυμικής ενεργότητας της DDC στο διαλυτό κλάσμα της κυτταρικής σειράς U937. Η εξωγενής χορήγηση του χημικού αναστολέα της DDC, carbidopa, σε καλλιέργεια κυττάρων U937 για 24 ώρες οδηγεί σε φαινόμενα κυτταροτοξικότητας κατά ένα δοσο-εξαρτώμενο τρόπο υποδεικνύοντας ότι η DDC μπορεί να εμπλέκεται σε μηχανισμούς επιβίωσης και κυτταρικού θανάτου των κυττάρων του ανοσοβιολογικού συστήματος. Ομοίως, επώαση των κυττάρων U937 παρουσία αυξανόμενων συγκεντρώσεων ντοπαμίνης για 24 ώρες οδηγεί σε κυτταρικό θάνατο. Τα αποτελέσματα αυτά ενισχύουν την υπόθεση ότι τα μακροφάγα είναι ικανά να παραλαμβάνουν την εξωκυττάρια ντοπαμίνη η οποία ρυθμίζει τον πολλαπλασιασμό και τον κυτταρικό θάνατο στα κύτταρα του ανοσοποιητικού συστήματος. • Απομόνωση και βιοχημικός χαρακτηρισμός ενός αναστολέα της ενζυμικής ενεργότητας της DDC από την κυτταρική σειρά U937 Η ύπαρξη του αναστολέα της ενζυμικής ενεργότητας της DDC στην κυτταρική σειρά U937 διαπιστώθηκε για πρώτη φορά μετά από επώαση δειγμάτων ομογενοποιήματος της κυτταρικής σειράς U937 παρουσία ομογενοποιήματος κυττάρων ΗΕK-293 που ως γνωστόν έχει υψηλά επίπεδα ενεργότητας L-Dopa αποκαρβοξυλάσης. Κλασμάτωση του ομογενοποιήματος κυττάρων U937 είχε ως αποτέλεσμα την ανάκτηση της ανασταλτικής ενεργότητας μόνο στο διαλυτό κλάσμα υποδηλώνοντας την υποκυτταρική τοπολογία του αναστολέα. Περαιτέρω μελέτη μέσω θερμοεπαγώμενου διαχωρισμού φάσεων παρουσία του μη-ιονικού απορρυπαντικού Triton X-114 οδήγησε σε ανάκτηση της ανασταλτικής ενεργότητας στην υδατική φάση του Triton X-114, επιβεβαιώνοντας την υδρόφιλη φύση του. Κατεργασία του διαλυτού κλάσματος των μακροφάγων (ΔΚΜ) με τις πρωτεάσες σερίνης, θρυψίνη, χυμοθρυψίνη και πρωτεϊνάση Κ, είχε ως συνέπεια την πλήρη απώλεια της ανασταλτικής του δράσης, υποδηλώνοντας την πρωτεϊνική φύση του αναστολέα της ενζυμικής ενεργότητας της DDC. Η πρωτεϊνική φύση του ρυθμιστικού μορίου επιβεβαιώθηκε μετά από μελέτη επίδρασης της ριβονουκλεάσης Α στην ανασταλτική ενεργότητα του ΔΚΜ. Η ανασταλτική δράση του ΔΚΜ επηρεάζεται από παραμέτρους, όπως ο χρόνος επώασης, το pH, η θερμοκρασία και η συγκέντρωση πρωτεΐνης. Με τη χρήση γενετικά τροποποιημένων κυτταρικών σειρών ως μοντέλα παραγωγής DDC και alt-DDC υποδεικνύεται ότι το ΔΚΜ αναστέλλει την ενζυμική ενεργότητα τόσο της πλήρους μήκους DDC, όσο και της alt-DDC. Η απομόνωση του αναστολέα από την κυτταρική σειρά U937 πραγματοποιήθηκε ακολουθώντας ένα πρωτόκολλο το οποίο περιλαμβάνει έξι στάδια καθαρισμού. Αρχικά, πραγματοποιήθηκε κλασμάτωση ομογενοποιήματος κυττάρων U937 και απομόνωση του διαλυτού κλάσματος. Δείγματα διαλυτού κλάσματος υπέστησαν κατεργασία με θειικό αμμώνιο και εν συνεχεία τα προϊόντα της αντίδρασης διαχωρίστηκαν σε υδρόφοβη στήλη phenyl sepharose. Ο αναστολέας απομονώθηκε μετά από ανάλυση των πρωτεϊνών που δεν προσδέθηκαν στη στήλη σε μη αποδιατακτικό πήκτωμα πολυακρυλαμίδης δύο διαστάσεων και συνεπακόλουθο διαχωρισμό και εκχύλιση των πρωτεϊνών από το πήκτωμα. Το πρωτόκολλο απομόνωσης είχε σαν αποτέλεσμα τον καθαρισμό του αναστολέα κατά 4.761 φορές. Η μοριακή μάζα του αναστολέα υπολογίστηκε ίση με 67 kDa, μετά από ανάλυση των δειγμάτων σε SDS πήκτω μα πολυακρυλαμίδης. Η ανασταλτική δράση του καθαρού αναστολέα της ενεργότητας της DDC επηρεάζεται από παραμέτρους, όπως ο χρόνος επώασης, το pH, η θερμοκρασία και η συγκέντρωση πρωτεΐνης. Πειράματα κινητικής ανάλυσης της αναστολής της ενεργότητας της DDC από τον καθαρό αναστολέα έδειξαν ότι ο τύπος της αναστολής είναι μη συναγωνιστικός με τιμή της σταθεράς Ki στα 10,59 μM. Ανάλυση των καθαρών δειγμάτων μέσω φασματομετρίας μάζας οδήγησαν στην ταυτοποίηση του αναστολέα ως αλβουμίνη του ορού. Η οριστική επιβεβαίωση της ταυτοποίησης του αναστολέα πραγματοποιήθηκε με τον έλεγχο επίδρασης υψηλής καθαρότητας ανθρώπινης αλβουμίνης ορού στην ενζυμική ενεργότητα DDC κυττάρων ΗΕΚ-293. Η αλβουμίνη του ανθρώπινου ορού, αναστέλλει την ενζυμική ενεργότητα της DDC όλων των υποκυτταρικών κλασμάτων της κυτταρικής σειράς U937. Με τη χρήση γενετικά τροποποιημένων κυτταρικών σειρών ως μοντέλα παραγωγής DDC και alt-DDC υποδεικνύεται ότι η ανθρώπινη αλβουμίνη ορού αναστέλλει την ενζυμική ενεργότητα τόσο της πλήρους μήκους DDC, όσο και της alt-DDC. Η απομόνωση και ο βιοχημικός χαρακτηρισμός της αλβουμίνης του ορού ως αναστολέα της ενζυμικής ενεργότητας της L-Dopa αποκαρβοξυλάσης παρουσιάζει ιδιαίτερο ενδιαφέρον διότι θα μπορούσε να εμβολιάσει νέες πειραματικές προσεγγίσεις οι οποίες θα έχουν ως τελικό στόχο την ανάπτυξη νέων φαρμακολογικών και θεραπευτικών μέσων για την καταπολέμηση νευροεκφυλιστικών και νεοπλασματικών νόσων. (EL)
L-3.4-dihydroxyphenyl-alanine decarboxylase (L-Dopa decarboxylase, or DDC, EC 4.1.1.26) is the enzyme which catalyzes the decarboxylation of L-Dopa to dopamine. Dopamine is considered to be one of the major mediators of the neural-immune communication since it has been found to be a regulating factor of the proliferation and differentiation of different leukocyte subtypes. Leukocytes interact with dopamine when, upon activation, cross the blood-brain barrier, but also in peripheral tissues as the white blood cells are capable of endogenous synthesis, secretion and uptake of catecholamines. The regulatory effect of dopamine occurs via dopamine receptors which are identified in the plasma membrane of white blood cells. Although several experimental data suggest the communication between the nervous and immune systems, the biosynthetic pathway of catecholamines in white blood cells, has not yet been fully elucidated. Additionally, the experimental data relating to the regulatory effect of dopamine appear contradictory. The need to further investigate the role of dopamine on immune system becomes more relevant when some of the most important neurodegenerative diseases such as Parkinson's disease and schizophrenia are well-correlated with severe abnormalities of immune functions. Therefore, fully clarification of the biochemical pathways dopamine is involved in may help in the understanding of the pathogenesis and treatment of many neurodegenerative diseases. Based on the above and on recent studies of our laboratory which revealed for the first time the expression of the full-length DDC and the alternative transcript lacking exon 3 in human peripheral leukocytes, the purpose of the present Ph.D. thesis was to further investigate the expression, the subcellular distribution and the enzymatic activity regulation of DDC in immune cells of human origin. The results of this dissertation are summarized as follows: • Study of the expression, topology and enzymatic activity of DDC in human peripheral white blood cells. In order to study the subcellular distribution of DDC in human peripheral white blood cells, samples of homogenized white blood cells were treated with the non-ionic detergent Triton X-114. The enzyme recovered both in the detergent enriched and highly hydrophobic phases, indicating the association of the molecule with the membrane fraction and the existence of multiple DDC subpopulations with variable degrees of hydrophobicity. Western blot analysis resulted in the detection of the alternative DDC isoform, alt-DDC. The enzyme was found to be active towards the decarboxylation of L-Dopa to DA (mU / mg = 3,67 ± 0,31). Although the obtained activity values were found to be considerably lower than the activity values observed in human embryonic kidney K293 cells, which were used as positive controls, the data strongly suggest the endogenous dopamine production in these types of cells. • Study of the expression, topology and enzymatic activity of DDC in U937cell line. To further investigate the expression, topology, and enzymatic activity of DDC in immune cells, U937 cell line was used as a model of macrophage function. DDC was detected for the first time in the cell line U937 by immonoblotting experiments. The nature of DDC mRNA expressed in U937 cell line was investigated by reverse transcription-polymerase chain reaction experiments and further Western bot analysis which lead to the detection of the neural-type DDC transcript lacking exon 3 and the protein isoform alt-DDC. The full-length transcript and the non-neural transcript were not detected. The subcellular distribution of DDC in U937 cell line was investigated using the non-ionic reagent Triton X-114. Treatment of samples with the detergent resulted in the recovery of DDC in the hydrophilic, hydrophobic, and the strong hydrophobic fraction, indicating the association of the enzyme with the membranes of U937 cell line. The membrane-associated DDC subpopulation was found to be released from the membrane fraction into the soluble fraction in a pH dependent manner with an optimum release at pH 6.0–6.5. Determination of DDC enzymatic activity in total homogenate, the soluble and membrane fraction of U937 cells suggests that DDC is enzymatically active towards the decarboxylation of L-Dopa to dopamine in all the subcellular fractions. The enzymatic activity levels of DDC in the membrane fraction were determined by 70% higher than the enzymatic activity values in total homogenate and the soluble fraction of the cell line. The solubilized molecule was found to be enzymatically active towards the decarboxylation of L-Dopa with a peak of activity between pH 6.0–6.5. Incubation of the membrane fraction in the presence of the soluble fraction resulted in a decrease of DDC activity suggesting the existence of a regulatory molecule of DDC activity in the soluble fraction of U937 cell line. Exogenous administration of the DDC inhibitor, carbidopa, to U937 cell culture for 24 hours was found to be cytotoxic in a dose-dependent manner, suggesting that DDC may be involved in immune cell survival and cell death mechanisms. Similarly, incubation of U937 cells in the presence of increasing dopamine concentrations for 24 hours lead to cell death. These results support the hypothesis that macrophages are able to uptake extracellular dopamine, which regulates proliferation and cell death in immune cells. • Isolation and biochemical characterization of a DDC enzymatic activity inhibitor from U937 cell line. The presence of the inhibitor of the enzymatic activity of DDC in U937 cell line was originally detected after the incubation of homogenized U937 cell samples in the presence homogenized HEK-293 cell samples which are known to contain high DDC activity levels. Fractionation experiments of U937 cell homogenate demonstrated the exclusive localization of the endogenous inhibitor of the enzymatic activity of DDC in the soluble fraction, suggesting the subcellular topology of the inhibitor. Further studies through temperature-induced phase separation in the presence of the non-ionic detergent Triton X-114 led to the recovery of the inhibitory activity in the aqueous phase of Triton X-114, confirming the hydrophilic nature of the inhibitory molecule. Treatment of the soluble fraction of macrophages (SFM) with serine proteases such as, trypsin, chymotrypsin and proteinase K, resulted in the total loss of inhibitory activity, suggesting the protein nature of the inhibitor. Treatment of the SFM with RNAse A verified the protein nature of the regulatory molecule. The inhibitory activity of the molecule was found to be regulated by pre-incubation time, pH, temperature and protein concentration. Using genetically modified cell lines (CHO) to model stable DDC and alt-DDC expressing cells, it was indicated that the regulatory molecule inhibits the enzymatic activity of the full length DDC as well as its truncated form, alt-DDC. Purification was achieved by means of ammonium sulphate precipitation, phenyl sepharose hydrophobic chromatography and subsequent extraction from a 2D non denaturing polyacrylamide gel. This purification scheme resulted in a 4.761-fold purification of the DDC activity inhibitory molecule. The molecular mass of the inhibitor was estimated at 67 kDa, following analysis of the samples on SDS-PAGE. The inhibitory activity of the purified molecule was found to be affected by various parameters, such as, protein concentration, incubation time, pH and temperature. Kinetic analysis experiments on DDC activity inhibition by the purified inhibitor showed that the mode of inhibition was competitive with a Ki value of 10.59 μΜ. Mass spectrometry results suggested that the inhibitor corresponds to serum albumin. Highly purified human serum albumin was tested for its inhibitory effect on human DCC activity (HEK-297 cells homogenate). Moreover, human serum albumin was found to inhibit the enzymatic activity of DDC derived from all the subcellular fractions of U937 cell line. Incubation of CHO cells transfected either with DDC or alt-DDC in the presence of the inhibitor indicated that human serum albumin inhibits the enzymatic activity of both full-length DDC, and alt-DDC. The purification and biochemical characterization of human serum alboumin as an inhibitor of the enzymatic activity of L-Dopa decarboxylase demonstrates a special interest, because it could be included in novel experimental approaches, which will have as a final target the development of novel pharmacological and therapeutic means for the combat of neurodegenerative and neoplasmic diseases. (EN)


Greek

Σχολή Θετικών Επιστημών » Τμήμα Βιολογίας » Τομέας Βιοχημείας Μοριακής Βιολογίας
Βιβλιοθήκη και Κέντρο Πληροφόρησης » Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών

https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/




*Institutions are responsible for keeping their URLs functional (digital file, item page in repository site)