Υπόβαθρο: Κατά το έτος 2011 παρατηρήθηκε μια σημαντική έξαρση στην εξάπλωση (1600%) του ιού της ανθρώπινης ανοσολογικής ανεπάρκειας τύπου 1 (HIV-1), μεταξύ χρηστών
ενδοφλέβιων ναρκωτικών (ΧΕΝ) στην Αθήνα, την πρωτεύουσα της Ελλάδας. Στην παρούσα μελέτη επιχειρείται να διακριθούν σχέσεις μεταξύ των δικτύων μετάδοσης του ιού και των δικτύων ενδοφλέβιας χρήσης RDS (Respondent Driven Sampling) των ΧΕΝ, όπως αυτά εκτιμήθηκαν με την μέθοδο RDS. Η παρούσα εργασία επικεντρώνεται στα τέσσερα μεγαλύτερα δίκτυα μετάδοσης αυτής της επιδημίας, αυτά των υπότυπων A, B, CRF14_BG και CRF35_AD.
Μέθοδος: Πραγματοποιήθηκε φυλογενετική ανάλυση στις αλληλουχίες του pol γονιδίου των HIV-1(+) ΧΕΝ που συμμετείχαν στη μελέτη. Με τη βοήθεια δύο προγραμμάτων, του FASTTREE και του RAxML, εντοπίσθηκαν εντός του κάθε ενός από τα τέσσερα κύρια δίκτυα μετάδοσης όλα τα επιμέρους δίκτυα μετάδοσης. Επιχειρήθηκε η διερεύνηση, στο βαθμό που αυτό ήταν εφικτό, της κοινωνικής δικτύωσης των ΧΕΝ μέσω των δικτύων ενδοφλέβιας χρήσης RDS και της ανάλυσης RDS. Το δείγμα αφορά τον πρώτο κύκλο συμμετοχής του προγράμματος ΑΡΙΣΤΟΤΕΛΗΣ στην Αθήνα. Η ανάλυση RDS πραγματοποιήθηκε με το RDSAT. Η διερεύνηση των σχέσεων μεταξύ των δικτύων μετάδοσης του ιού και των δικτύων RDS των ΧΕΝ στην Αθήνα, πραγματοποιήθηκε με δύο διαδικασίες. Κατά τη μία, υπολογίσθηκε ο δείκτης Homophily, μέσω της ανάλυσης RDS, για κάθε μια ομάδα υπότυπου των HIV(+) ΧΕΝ. Κατά τη δεύτερη διαδικασία, εξετάσθηκε αν τα άτομα τα οποία ανήκαν στο ίδιο υπο-δίκτυο μετάδοσης του ιού (bootstrap values > 75%), συνέβαινε να βρίσκονται κοντά και στα δίκτυα RDS.
Αποτελέσματα: Στο σύνολο του δείγματος ο δείκτης H για τους ΧΕΝ των δικτύων μετάδοσης CRF14_BG, CRF35_AD, Α, και Β υπολογίσθηκε 0.16, -1, -1 και 0.034 αντίστοιχα. Εντός του υποσυνόλου των ΗΙV(+) ΧΕΝ, ο δείκτης H εκτιμήθηκε 0.229 (CRF14_BG), -1 (CRF35_AD), -1 (Α) και 0.009 (Β). Εντοπίσθηκαν 5 υπο-δίκτυα μετάδοσης του ιού, με εύρος 2 αλληλουχιών, και 1 υπο-δίκτυο με 5 αλληλουχίες. Οι 4 HIV(+) (26.7%) που εντοπίστηκαν σε υπο-δίκτυα βρέθηκε ότι ανήκαν στο ίδιο δίκτυο RDS.
Συμπεράσματα: Στην παρούσα εργασία αναδεικνύεται η ύπαρξη σχέσης μεταξύ των δικτύων RDS των ΧΕΝ και των δικτύων μετάδοσης του ιού. Το αποτέλεσμα αυτό υποδεικνύει ότι τα άτομα με δικτύωση RDS είχαν αυξημένη πιθανότητα μεταξύ τους μετάδοσης της HIV-λοίμωξης. Για τα δίκτυα μετάδοσης των υπότυπων Α και CRF35_AD δεν εντοπίσθηκε κάποια συσχέτιση με τα δίκτυα RDS. Αυτό είναι πιθανό να οφείλεται από τη μία στο σχετικά μικρό μέγεθος των δύο αυτών δικτύων και από την άλλη στο γεγονός ότι αυτά τα δύο δίκτια δεν ήταν
πλέον ενεργά κατά την περίοδο συμμετοχής στον πρώτο κύκλο του προγράμματος ΑΡΙΣΤΟΤΕΛΗΣ σε αντίθεση με τα δίκτυα B και CRF14_BG.
Συζήτηση: Η διαδικασία RDS, αν και πετυχαίνει να προσεγγίσει τον κλειστό πληθυσμό των ΧΕΝ, μειονεκτεί στο να καταγράφει με ακρίβεια τις ανά δύο κοινωνικές σχέσεις μεταξύ των συμμετεχόντων. Το γεγονός αυτό πιθανόν να συνετέλεσε στην μη ανάδειξη επιπλέον στοιχείων που να υποστηρίζουν την πιθανή συσχέτιση μεταξύ των δικτύων μετάδοσης και των δικτύων RDS. Νέες προτάσεις θα πρέπει να κατατεθούν στο μέλλον και να διεξαχθούν μελέτες, ώστε να καταστήσουν εφικτή τη διερεύνηση τέτοιων σχέσεων, σε περιπτώσεις επιδημιών σε πληθυσμούς όπως οι ΧΕΝ, με πρώτο στόχο την καλύτερη κατανόηση των μηχανισμών εξάπλωσης της εκάστοτε επιδημίας και τελικά, τον αποτελεσματικό και γρήγορο περιορισμό της.
(EL)
Objective: In 2011, a significant increase (1600%) in the number of newly diagnosed HIV-1 (Human Immunodeficiency Virus) infections among intravenous drug users (IDUs) was observed in Athens, the capital of Greece. In the present study, it was attempted to distinguish possible associations between the virus’ transmission networks and intravenous drug use RDS (Respondent Driven Sampling) networks, as evaluated by the RDS method. This paper focuses on the four major transmission networks identified in this specific epidemic, those of A, B, CRF14_BG and CRF35_AD subtypes.
Method: Phylogenetic analysis of pol gene sequences of the HIV-1(+) IDUs participants was conducted. Using two packages, FASTTREE and RAxML, transmission clusters were identified within each of the 4 major transmission networks. The investigation, to the extent that this was possible, of the social IDUs networks, as defined through the intravenous drug use RDS networks and the RDS analysis, was attempted. The sample consists of the participants of the first round of Aristotle program that was conducted in Athens. RDS analysis was performed using RDSAT. The investigation of the existence of possible association between the virus’ transmission networks and RDS networks was conducted using two approaches. In the first approach, Homophily index was calculated, using RDS analysis, for each subtype group of the HIV(+) IDUs. In the second approach, it was examined whether HIV(+) IDUs that belonged to the same transmission cluster (bootstrap values > 75%), happened to also be close in the RDS networks.
Results: In the total sample, H index for IDUs in the CRF14_BG, CRF35_AD, Α, and Β transmission networks was estimated as 0.16, -1, -1 and 0.03, respectively. In the ΗΙV(+) IDUs subgroup, H index was estimated 0.229 (CRF14_BG), -1 (CRF35_AD), -1 (Α) and 0.009 (Β). 5 transmission clusters, with a range of 2 sequencies, and 1 cluster with 5 sequences were identified. 4 HIV(+) IDUs (26.7%) found in the same transmission cluster were also found in the same RDS network and were closely associated.
Conclusion: This research points out the relationship between HIV-1 IDUs’ transmission networks and RDS networks in the HIV-1 outbreak in Athens, 2011. Hence, IDUs that were tied at the RDS networks had higher odds to be mutually infected. For the transmission networks of the CRF35_AD and A subtypes, we know that during the sampling period they were inactive. This might be a reason for the Homophily index value that was found during the RDS analysis for these two subtype networks. We found few HIV transmissions corresponding directly with the RDS recruitment. However, when the HIV(+) IDUs of a transmission cluster were also members of the same RDS network, they were directly connected (1st or 2nd degree connections).
Discussion: RDS sampling method, and consequently RDS analysis, seems to be a method that generates relatively unbiased samples of the population, managing to adequately describe the population’s network general structure. However, this method is not proper to describe thoroughly all of the pairwise relationships among the subjects. Nonetheless, it seems that there is a relationship between the RDS networks and HIV-1 transmission networks, indicating that the method may be able to reveal at least part of the real association between IDUs’ HIV epidemic and their social networks.
(EN)
/aggregator-openarchives/portal/institutions/uoa
