Ο καρκίνος του παχέος εντέρου (Colorectal cancer, CRC) αποτελεί τον τρίτο συχνότερο τύπο καρκίνου με 1.931.590 νέα περιστατικά και δεύτερο σε θνησιμότητα με 935.173 παγκόσμια για το έτος 2020. Εκτιμάται ότι ο αριθμός των νέων περιστατικών CRC θα αυξηθεί κατά 63% ενώ η θνησιμότητα θα αυξηθεί κατά 73% μέχρι το 2040. Οι εφαρμογές της υγρής βιοψίας στον CRC αναμένεται να δώσουν ουσιαστικές λύσεις στη διαχείριση των ασθενών.
Οι επιγενετικές τροποποιήσεις αποτελούν ένα από τα χαρακτηριστικά του καρκίνου. Η μεθυλίωση του DNA αποτελεί τον πιο σημαντικό και καλά μελετημένο επιγενετικό μηχανισμό στον καρκίνο. Στον CRC, η μεθυλίωση του DNA έχει βρεθεί ότι εμπλέκεται στα μονοπάτια της καρκινογένεσης. Το 17% των σποραδικών CRC παρουσιάζουν τον φαινότυπο μεθυλίωσης των νησίδων CpG (CpG Island Methylator Phenotype, CIMP), ο οποίος χαρακτηρίζεται από την υπερμεθυλίωση πολλών γονιδίων σε νησίδες CpG στην περιοχή των υποκινητών τους. Πρόσφατα, εγκρίθηκε από τον FDA το πρώτο τεστ σε ελεύθερο κυττάρων DNA (cell-free DNA, cfDNA) πλάσματος για τον προσυμπτωματικό έλεγχο του πληθυσμού για τον CRC (Epi proColon, Epigenomics AG, Germany), που ανιχνεύει τη μεθυλίωση στον υποκινητή του γονιδίου SEPT9.
Στην παρούσα εργασία μελετήθηκε η μεθυλίωση του υποκινητή των γονιδίων WIF-1, APC, RASSF1A σε δείγματα cfDNA πλάσματος από ασθενείς με CRC σταδίου ΙΙ-ΙΙΙ πριν και μετά από το χειρουργείο και η συσχέτισή της με τα επίπεδα των καρκινικών δεικτών CEA και CA 19-9 σε ορό αίματος και με το MSI status των ασθενών. Συνολικά, εξετάσθηκαν 42 δείγματα cfDNA πλάσματος, 26 προεγχειρητικά και 16 μετεγχειρητικά από 28 ασθενείς με CRC. Επιπλέον, διενεργήθηκε σε δείγματα ορού από τους 28 ασθενείς η ανάλυση για τον προσδιορισμό των καρκινικών δεικτών CEA και CA 19-9.
(EL)
Colorectal cancer (CRC) is the third most common type of cancer with 1,931,590 new cases and second in mortality with 935,173 worldwide for the year 2020. It is estimated that the number of new CRC cases will increase by 63% while the mortality will increase by 73% by 2040. Applications of liquid biopsy in CRC are expected to provide substantial solutions in patient management.
Epigenetic modifications consist one of the major hallmarks of cancer. DNA methylation is the most important and well-studied epigenetic mechanism in cancer. In CRC, DNA methylation has been found to be involved in the pathways of carcinogenesis. 17% of sporadic CRCs show the CpG Island Methylator Phenotype (CIMP), which is characterized by the hypermethylation of many genes at CpG islands in their promoter region. Recently, the first plasma cell-free DNA (cfDNA) test for population screening for CRC (Epi proColon AG, Germany), which detects methylation in the SEPT9 gene promoter, was approved by the FDA.
In the present study, we studied promoter methylation of the WIF-1, APC and RASSF1A genes in plasma-cfDNA samples from CRC patients and correlated our findings with the levels of the cancer markers CEA and CA 19-9 in blood serum and with the MSI status of the patients. In total, 42 plasma cfDNA samples, 26 preoperative and 16 postoperative from 28 CRC patients, were examined. In addition, serum samples from the 28 patients were analyzed to determine the tumor markers CEA and CA 19-9 before and after surgery.
(EN)
University of Athens
