1. Αρχική σελίδα
  2. Αναζήτηση

Role of Micro-RNAs in gastrointestinal stromal tumors

Το τεκμήριο παρέχεται από τον φορέα :
Εθνικό Κέντρο Τεκμηρίωσης και Ηλεκτρονικού Περιεχομένου (ΕΚΤ)   

Αποθετήριο :
Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών  | ΕΚΤ ΕΑΔΔ   

δείτε την πρωτότυπη σελίδα τεκμηρίου
στον ιστότοπο του αποθετηρίου του φορέα για περισσότερες πληροφορίες και για να δείτε όλα τα ψηφιακά αρχεία του τεκμηρίου*



Ο ρόλος των Micro-RNAs στους στρωματικούς όγκους του γαστρεντερικού συστήματος
Role of Micro-RNAs in gastrointestinal stromal tumors
Stefanou, Ioannis
Στεφάνου, Ιωάννης
PhD Thesis
2023
Η παρούσα διδακτορική διατριβή αποτελεί μια αναδρομική κλινικοεργαστηριακή μελέτη, στην οποία διερευνήσαμε τα πρότυπα έκφρασης των micro-RNAs σε δείγματα ιστών που αφορούσαν γαστρικούς όγκους στομάχου σε σύγκριση με μη νεοπλασματικούς γαστρικούς ιστούς. Εκτός της ανάλυσης των miRNAs με την μηχανή ανίχνευσης RNA αλληλουχιών νέας γενιάς, εφαρμόσαμε αλγοριθμικά μοντέλα μηχανικής εκμάθησης (machine learning models) με σκοπό να αναδείξουμε τα σημαντικότερα miRNAs ως προγνωστικούς δείκτες κακοήθειας. Οι νεοπλασματικοί ιστοί που μελετήθηκαν αφορούν χειρουργικές εκτομές στρωματικών όγκων στομάχου, ενώ οι υγιείς αντιστοιχούν σε βιοψίες από ενδοσκοπήσεις ανωτέρου πεπτικού για καλοήθεις παθήσεις. Τα στοιχεία των ασθενών συλλέχθηκαν από το αρχείο του Γ.Ν.Ιπποκρατείου Αθηνών και η διεξαγωγή του εργαστηριακού τμήματος της μελέτης πραγματοποιήθηκε στο Εργαστήριο Βιολογίας Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου Αθηνών.Για τα περισσότερα από τα miRNA που βρήκαμε να έχουν στατιστικά σημαντική διαφοροποίηση στην έκφρασή τους (GISTs vs Controls), είχε περιγραφεί η συσχέτισή τους με τα GIST σε προηγηθείσες μελέτες. Πιο συγκεκριμένα βρήκαμε ότι τα hsa-miR-196a-5p, hsamiR-148a-3p and hsamiR-125a-5p υπερεκφράζονται στα GIST, ενώ τα hsamiR- let-7f-5p, hsamiR- 126-3p, hsa-miR-222-3p, hsa-miR-146a-5p, hsa-miR- 218-5p μεταξύ άλλων, εμφανίζουν μειωμένη έκφραση. Τα αποτελέσματα της μελέτης μας υποδηλώνουν ότι τα εν λόγω miRNAs θα μπορούσαν να χρησιμεύσουν ως προγνωστικοί δείκτες για την ανάπτυξη των GISTs.
BACKGROUND: Gatrointestinal stromal tumors (GISTs) are the main mesenchymal tumors found in the gastrointestinal system. GISTs clinical phenotypes differ significantly and their molecular basis is not yet completely known. microRNAs (miRNAs) have been involved in carcinogenesis pathway by regulating gene expression at post-transcriptional level.OBJECTIVE: The aim of the present study was to elucidate the expression profiles of miRNAs relevant to GIST carcinogenesis and to identify the miRNA signature that can discriminate GISTs from normal cases.METHODS: miRNAs expression was tested by miScript™ miRNA PCR Array Human Cancer PathwayFinder kit and then we used a machine learning in order to find a miRNA profile that can predict the risk for GIST development. RESULTS: A number of miRNAs were found to be differentially expressed in GIST cases compared to healthy controls. Among them the Hsa-miR-218-5p was found to be the best predictor for GIST development in our cohort. Additionally, hsa-miR-146a-5p, hsa-miR-222-3p, and hsa-miR-126-3p exhibit significantly lower expressions in GIST cases compared to the controls, and were among the top predictors in all of our predictive models.
Ιατρική και Επιστήμες Υγείας ➨ Κλινική Ιατρική ➨ Χειρουργική
Αλγόριθμοι μηχανικής εκμάθησης
GIST
Machine learning algorithms
Medical and Health Sciences
Στρωματικοί όγκοι του γαστρεντερικού συστήματος
Κλινική Ιατρική
micro-RNAs
Non-coding RNAs (ncRNAs)
Clinical Medicine
Μη μεταφράσιμα RNA
Surgery
Βιοπληροφορική
Micro-RNAs
Χειρουργική
Bioinformatics
Ιατρική και Επιστήμες Υγείας
Ελληνική γλώσσα
National and Kapodistrian University of Athens
Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ)
Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ). Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικής. Τομέας Χειρουργικής. Κλινική Α' Προπαιδευτική Χειρουργική και Χειρουργικής Παθολογίας Περιφερειακού Γενικού Νοσοκομείου ΙΠΠΟΚΡΑΤΕΙΟ Αθηνών
Εθνικό Κέντρο Τεκμηρίωσης και Ηλεκτρονικού Περιεχομένου (ΕΚΤ)
Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών
Συλλογή ΕΑΔΔ



*Η εύρυθμη και αδιάλειπτη λειτουργία των διαδικτυακών διευθύνσεων των συλλογών (ψηφιακό αρχείο, καρτέλα τεκμηρίου στο αποθετήριο) είναι αποκλειστική ευθύνη των αντίστοιχων Φορέων περιεχομένου.