Comparative analysis of geochemical variables, macrofaunal and microbial communities in Lagonal ecosystems

This item is provided by the institution :
University of Crete   

Repository :
E-Locus Institutional Repository   

see the original item page
in the repository's web site and access all digital files if the item*



Συγκριτική ανάλυση γεωχημικών μεταβλητών και μακροπανιδικών και μικροβιακών κοινοτήτων σε λιμνοθαλάσσια οικοσυστήματα
Comparative analysis of geochemical variables, macrofaunal and microbial communities in Lagonal ecosystems

Παυλούδη, Χριστίνα

Καρακάσης, Ιωάννης
Κωτούλας, Γεώργιος
Αρβανιτίδης, Χρήστος

text
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης

2012-11-16


Οι λιμνοθάλασσες είναι γενικά εμπλουτισμένα ενδιαιτήματα με πολύ ασταθείς περιβαλλοντικές συνθήκες, εξαιτίας του περιορισμού τους από την ανοιχτή θάλασσα και του μικρού βάθους τους. Οι συχνές διακυμάνσεις των αβιοτικών παραμέτρων προκαλούν σημαντικές μεταβολές στην αφθονία και την κατανομή των οργανισμών. Αυτή η σχέση έχει μελετηθεί εκτενώς όσον αφορά τους μακροπανιδικούς οργανισμούς, αλλά όχι επαρκώς για τους μικροοργανισμούς των λιμνοθαλασσών. Στόχος της παρούσας μελέτης ήταν η διερεύνηση των προτύπων κατανομής της βιοποικιλότητας των μικροβιακών κοινοτήτων, η συσχέτισή τους με περιβαλλοντικές μεταβλητές περιλαμβανομένων των βαρέων μετάλλων και συναφών χημικών στοιχείων, και η αλληλοσυσχέτισή τους με τα αντίστοιχα μακροπανιδικά. Για το σκοπό αυτό, συλλέχθηκαν δείγματα ιζήματος από τέσσερις λιμνοθάλασσες του Αμβρακικού κόλπου (Ιόνιο Πέλαγος). Σε κάθε λιμνοθάλασσα επιλέχθηκαν δύο σταθμοί δειγματοληψίας, με διαφορετικό βαθμό επικοινωνίας με τη θάλασσας. Εκτιμήθηκε πληθώρα αβιοτικών παραμέτρων για κάθε σταθμό, συμπεριλαμβανομένων των συγκεντρώσεων βαρέων μετάλλων και στοιχείων. Συλλέχθηκαν δείγματα πολυχαίτων για τα οποία ακολούθησε ταξινομικός προσδιορισμός στο επίπεδο του είδους. Ακολούθησε η εξαγωγή μικροβιακού γενετικού υλικού από το ανώτερο στρώμα του ιζήματος, από το οποίο, με αλληλούχιση νέας γενιάς, εκτιμήθηκε η αφθονία και η ποικιλότητα των προκαρυωτών, βάσει της περιοχής V5-V6 του γονιδίου 16S rRNA. Από την ανάλυση των αποτελεσμάτων προέκυψε ότι στο συγκεκριμένο λιμνοθαλάσσιο οικοσύστημα, οι μακροπανιδικές συνευρέσεις δε φαίνεται να επηρεάζονται από τις ίδιες περιβαλλοντικές παραμέτρους που επηρεάζουν την κατανομή των μικροβιακών κοινοτήτων και επιπλέον, τα πρότυπα κατανομής των προκαρυωτών και των πολυχαίτων δεν εμφάνισαν σημαντική συσχέτιση. Τόσο οι μικροβιακές κοινότητες όσο και οι συνευρέσεις των πολυχαίτων επηρεάζονται από τη συνεργιστική δράση πολλαπλών αβιοτικών παραμέτρων, γεγονός που ενισχύει την υπόθεση της περιβαλλοντικής δριμύτητας πολλαπλών αιτιών (multicausal environmental severity hypothesis). Τέλος, τα αποτελέσματα της παρούσας εργασίας συνηγορούν στην άποψη της χρησιμοποίησης των μικροβιακών κοινοτήτων ως βιοδεικτών για την εκτίμηση της οικολογικής κατάστασης των λιμνοθαλάσσιων οικοσυστημάτων, κυρίως εξαιτίας της μεγάλης οργανισμικής και λειτουργικής ποικιλότητάς τους. (EL)
Lagoons are enriched habitats, with unstable environmental conditions caused by their confinement from the sea and their shallow depth. Τhe frequent fluctuations of the abiotic parameters cause severe changes in the abundance and distribution of organisms. This relationship has been studied extensively for macrofaunal species, but not sufficiently for the lagoonal microbial diversity. The aim of the present study was to explore the biodiversity patterns of microorganismic assemblages and to examine whether these patterns are associated with those of the contextual environmental parameters and the macrofaunal ones. For this purpose, sediment samples were collected from four lagoons, located in Amvrakikos Gulf (Ionian Sea, Western Greece). In each lagoon, two sampling stations were chosen, with different connectivity degree with the sea. A number of abiotic parameters were measured for every station, including the sediment concentrations of heavy metals and elements. Polychaete samples were collected and identified at the species level. Microbial DNA was extracted from the sediment upper layer (0-2cm) and was further processed through deep sequencing of the V5-V6 region of the 16S rRNA gene by next generation sequencing. The results of this study suggest that, in the studied lagoonal ecosystem, the macrofaunal assemblages do not seem to be affected by the sane environmental parameters the affect the distribution of the microbial community, and that the distribution patterns of the prokaryotes and the polychaetes are not correlated. Both the microbial communities and the polychaete assemblages are affected by the synergistic action of multiple abiotic parameters, denoting the importance of the «multicausal environmental severity hypothesis» for these ephemeral ecosystems. Finally, the findings of this study provide support to the aspect of the use of the microbial communities as bioindicators of the ecological status of the lagoonal ecosystems; their advantage is largely owed to their larger organismic and functional diversity. (EN)


Πυροαλληλούχιση
Amvrakikos gulf
Pyrosequencing
Microbial diversity
Λιμνοθάλασσα
Μικροβιακή ποικιλότητα
Αμβράκικος κόλπος
Heavy metals

Greek





*Institutions are responsible for keeping their URLs functional (digital file, item page in repository site)