Μοριακός χαρακτηρισμός μιας λειτουργικά απαραίτητης αλληλουχίας της SecA

Το τεκμήριο παρέχεται από τον φορέα :
Πανεπιστήμιο Κρήτης   

Αποθετήριο :
E-Locus Ιδρυματικό Καταθετήριο   

δείτε την πρωτότυπη σελίδα τεκμηρίου
στον ιστότοπο του αποθετηρίου του φορέα για περισσότερες πληροφορίες και για να δείτε όλα τα ψηφιακά αρχεία του τεκμηρίου*



Μοριακός χαρακτηρισμός μιας λειτουργικά απαραίτητης αλληλουχίας της SecA

Παπανίκου, Ευφροσύνη
Papanikou, Efrosini

text
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης

2001-12-06


Η SecA αποτελεί την κινητήρια υπομονάδα της βακτηριακής μεταθετάσης και έχει ενεργότητα RNA ελικάσης. Αποτελείται από δύο διακριτές δομικές περιοχές: το καρβοξυτελικό τμήμα με ρόλο στο διμερισμό της και το αμινοτελικό τμήμα που έχει τη δράση ATPάσης. Το αμινοτελικό της τμήμα είναι οργανωμένο όπως το ενεργό κέντρο των DEAD πρωτεϊνών και περιέχει τα εφτά συντηρημένα μοτίβα των DEAD ελικασών της δεύτερης υπεροικογένειας. Αποτελείται από την NBD περιοχή που συνιστά τη θέση δέσμευσης νουκλεοτιδίου και την IRA2 περιοχή στην οποία δύο συντηρημένα μοτίβα της DEAD οικογένειας κατέχουν σημαντικό ρόλο στην αλληλεπίδραση NBD/IR2, στην αποτελεσματικότητα της υδρόλυσης αλλά και στην μετατόπιση προπρωτεϊνών. Στην παρούσα εργασία, δείξαμε ότι μια συντηρημένη αλληλουχία (μοτίβο VII) που βρίσκεται μεταξύ του NBD και του IRA2, είναι απαραίτητη για τη μετατόπιση πολυπεπτιδικών υποστρωμάτων. Η αλληλουχία αυτή είναι ομόλογη με το μοτίβο ΙΙΙ των ελικασών της δεύτερης υπεροικογένειας. SecA πρωτείνες με μεταλλάξεις στο μοτίβο VII παρουσιάζουν προβλήματα δομικής σταθερότητας, μειωμένη ικανότητα υδρόλυσης ATP και εκκριτική ανικανότητα. Το μοτίβο VII πιθανόν να επηρεάζει έμμεσα την επικοινωνία των NBD και IRA2 καθώς και τη δέσμευση υποστρώματος αφού κείται σε περιοχή που γειτνιάζει με την προτεινόμενη ως περιοχή δέσμευσης πρωτεϊνικών υποστρωμάτων. (EL)
SecA, the motor subunit of bacterial polypeptide translocase is an RNA helicase. SecA comprises a dimerization C-domain fused to an ATPase N-domain. The N-domain is organized like the motor core of DEAD proteins and contains seven conserved DEAD helicase motifs. It encompasses two subdomains, NBD and IRA2. NBD is the nucleotide binding domain and IRA2 contains two DEAD family motifs which are essential for IRA2/NBD binding, optimal nucleotide turnover and polypeptide translocation. With the current study, we demonstrated that a conserved SecA region (motif VII), that lies between IRA2 and NBD, is essential for polypeptide translocation. Motif VII is homologous to motif III of DEAD RNA helicases. Mutants in motif VII cannot translocate polypeptides, they exhibit reduced catalytic activity and/or their folding is affected. We suggest that motif VII is important for the communication between NBD and IRA2 as well as for substrate's successful binding since it is located near the proposed PBD of SecA. (EN)


Ελληνική γλώσσα





*Η εύρυθμη και αδιάλειπτη λειτουργία των διαδικτυακών διευθύνσεων των συλλογών (ψηφιακό αρχείο, καρτέλα τεκμηρίου στο αποθετήριο) είναι αποκλειστική ευθύνη των αντίστοιχων Φορέων περιεχομένου.