Εισαγωγή: Ο ιός HIV είναι ο αιτιολογικός παράγοντας του AIDS. Ο ιός
χαρακτηρίζεται από εκτενή γενετική ετερογένεια και ταξινομείται παγκοσμίως σε
τέσσερις ομάδες, από τις οποίες η Μ είναι υπεύθυνη για την πανδημία του ΑIDS
και ταξινομείται φυλογενετικά σε εννέα υπότυπους, υπό-υπότυπους και σε
ανασυνδυασμένους τύπους. Η επιδημία του HIV-1 στην Ελλάδα μέχρι και το έτος
2010 αφορούσε κυρίως ομοφυλόφιλους άνδρες. Από το 2011 όμως παρατηρήθηκε μια
ραγδαία αύξηση κρουσμάτων HIV-1 σε χρήστες ενδοφλέβιων ναρκωτικών (ΧΕΝ).
Μέθοδοι: Μελετήθηκαν 65 αλληλουχίες οροθετικών ΧΕΝ, οι οποίοι προέρχονταν από
χώρες της Ασίας, της Ευρώπης και της Αφρικής. Ο χαρακτηρισμός της
νουκλεοτιδικής αλληλουχίας πραγματοποιήθηκε κατόπιν PCR αντίστροφης μεταγραφής
και μη-εμπορικά διαθέσιμης διπλής PCR στις περιοχές της πρωτεάσης (PR) και
αντίστροφης μεταγραφάσης (RT) και στη συνέχεια ακολούθησε φυλογενετική ανάλυση.
Αποτελέσματα: Αναπτύχθηκε επιτυχώς μια μη-εμπορικά διαθέσιμη μέθοδος
ταυτοποίησης της νουκλεοτιδικής αλληλουχίας του HIV για τις περιοχές της PR και
της RT. Σύμφωνα με τα αποτελέσματα της φυλογενετικής ανάλυσης, ο υπότυπος που
κυριαρχεί ανάμεσα στους ΧΕΝ είναι ο ανασυνδυασμένος τύπος CRF14_BG με ποσοστό
επιπολασμού 72,3%. Ακολουθεί το ανασυνδυασμένο στέλεχος CRF35_ΑD και ο υπότυπος
Β με ποσοστά επιπολασμού 12,3% και 9,2% αντίστοιχα. Με μικρότερη συχνότητα
εμφανίζονται οι υπότυποι Α και Α1 με ποσοστά επιπολασμού 3,1% ο καθένας.
Συμπεράσματα: Οι αλληλουχίες των ΧΕΝ ομαδοποιούνται σε δύο μεγάλες
φυλογενετικές ομάδες: την ομάδα υπότυπου CRF14_BG και την ομάδα υπότυπου
CRF35_AD. Για πρώτη φορά ταυτοποιείται επιδημία με ανασυνδυασμένους υπότυπους
(CRFs) στο δίκτυο των ΧΕΝ.
(EL)
Background: Human immunodeficiency virus (HIV), the etiologic agent of
Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS), is characterized by genetic
heterogeneity and is globally classified into four groups, of which group M is
responsible for AIDS pandemic and is phylogenetically classified into nine
subtypes, sub-subtypes and recombinant forms. Until 2010, the majority of cases
of HIV-1 infection in Greece were men who have sex with men. However, during
2011, a significant increase in the number of newly diagnosed HIV-1 infections
among injecting drug users (IDUs) was observed.
Methods: Sixty-fiveDNA sequences from HIV-positive injecting drug users, from
Asia, Europe and Africa were analyzed. Specifically, everse transcription-PCR,
in house nested PCR, DNA-sequencing and phylogenetic analysis of protease (PR)
and reverse-transcriptase (RT) regions were conducted.
Results: An in house molecular assay for the characterization of PR and RT HIV
regions was developed. Phylogenetic analysis revealed that the most prevalent
subtype among IDUs is CRF14_BG (72.3%), followed by CRF35_AD (12.3%), subtype B
(9.2%), subtype A (3.1%) and subtype A1 (3.1%).
Conclusions: The sequences of IDUs are grouped into two major phylogenetic
clusters: CRF14_BG and CRF35_AD. We identified for the first time a HIV-1
epidemic with recombinant forms in the network of IDUs.
(EN)
/aggregator-openarchives/portal/institutions/uoa
