Εφαρμογή φασματοσκοπίας πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού και μοριακής δυναμικής στη διαμορφωτική ανάλυση δύο C2-υποκατεστημένων διμερών πυρρολο[2,3-f]κινολινών
δείτε την πρωτότυπη σελίδα τεκμηρίου στον ιστότοπο του αποθετηρίου του φορέα για περισσότερες πληροφορίες και για να δείτε όλα τα ψηφιακά αρχεία του τεκμηρίου*
Εφαρμογή φασματοσκοπίας πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού και μοριακής δυναμικής στη διαμορφωτική ανάλυση δύο C2-υποκατεστημένων διμερών πυρρολο[2,3-f]κινολινών
Στην παρούσα διπλωματική εργασία πραγματοποιήθηκε διαμορφωτική ανάλυση δυο
C2-υποκατεστημένων [2,3-f]κινολινών που παρουσιάζουν κυτταροτοξικό χαρακτήρα
και πιθανή αντικαρκινική δράση. Αρχικά μελετήθηκαν τα πειραματικά δεδομένα
φασματοσκοπίας Πυρηνικού Μαγνητικού Συντονισμού μίας και δύο διαστάσεων για τη
διερεύνηση των διαμορφώσεων που λαμβάνουν οι ενώσεις. Στη συνέχεια,
πραγματοποιήθηκε διαμορφωτική ανάλυση των ενώσεων με τη βοήθεια υπολογιστικών
μεθόδων μοριακής δυναμικής υπό συνθήκες κενού, υδατικού περιβάλλοντος και
περιβάλλοντος διαλύτη διμεθυλοσουλφοξειδίου (DMSO). Ακολούθως, οι ενώσεις
μελετήθηκαν για την ικανότητά τους να διαπερνούν τον υδάτινο φραγμό των
λιπιδικών διπλοστιβάδων και να εισέρχονται σε αυτές, με πειράματα μοριακής
δυναμικής. Τέλος, μελετήθηκε η μοριακή πρόσδεση των ενώσεων αυτών σε
αλληλουχίες νουκλεοτιδίων (DNA) για τη διερεύνηση του τρόπου δράσης τους.
Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι οι ενώσεις αυτές στα διάφορα περιβάλλοντα και
στόχους δράσης λαμβάνουν εκτεταμένες δομές, σε συμφωνία με τα πειραματικά
δεδομένα NMR όπου δεν παρατηρήθησαν μεγάλης εμβέλειας NOEs. Η βιολογική σημασία
αυτών των αποτελεσμάτων είναι υπό μελέτη.
(EL)
In the present thesis a conformational analysis of two C2-substituted [2,3-f]
quinolines presenting cytotoxic and potential anticancer activity was applied.
Initially, the experimental data of one- and two- dimensional nuclear magnetic
resonance spectra were analyzed to structurally elucidate them and search their
conformational properties. Then, a conformational analysis of the compounds
under study was performed, using computational methods and molecular dynamics
procedures in vacuum, in water solution environment and in DMSO solution
environment. Subsequently, the compounds were studied for their ability to
cross the water barrier of lipid bilayers and enter within the bilayer core
using molecular dynamics experiments. Finally, the molecular docking of these
compounds in nucleotide sequences (DNA) was studied, in order to investigate
their mode of action, as DNA constitutes their target.
The obtained results showed that these compounds adopt an extended conformation
in all environments studied. This is in accordance with NMR data which showed
no wide range NOEs. The biological consequences of these results are under
study.
(EN)
*Η εύρυθμη και αδιάλειπτη λειτουργία των διαδικτυακών διευθύνσεων των συλλογών (ψηφιακό αρχείο, καρτέλα τεκμηρίου στο αποθετήριο) είναι αποκλειστική ευθύνη των αντίστοιχων Φορέων περιεχομένου.
Βοηθείστε μας να κάνουμε καλύτερο το OpenArchives.gr.