Η Β - Χρόνια Λεμφοκυτταρική Λευχαιμία (B - CLL) αποτελεί την πιο κοινή λευχαιμία
στους ενήλικες στον Δυτικό κόσμο και προσβάλλει κυρίως ηλικιωμένα άτομα.
Αποτελεί μία νεοπλασματική κακοήθεια όπου τα Β - λεμφοκύτταρα
πολλαπλασιάζονται και συσσωρεύονται στο περιφερικό αίμα και στους λεμφικούς
ιστούς λόγω δυσλειτουργίας, κυρίως, των μηχανισμών απόπτωσης. Επίσης, η
συνεχής ενεργοποίηση του υποδοχέα των Β – λεμφοκυττάρων, BCR (B Cell Receptor),
από μεταγραφικούς παράγοντες, και κατά συνέπεια και ενεργοποίηση των
σηματοδοτικών μονοπατιών που ελέγχονται από αυτόν, οδηγεί στην ενεργοποίηση
γονιδίων που επάγουν τον κυτταρικό πολλαπλασιασμό και την μακρά επιβίωση, και
αναστέλλουν την απόπτωση. Έτσι, στην παρούσα Διπλωματική Εργασία, μελετήθηκε
πειραματικά η διαφορική έκφραση των γονιδίων TNFRSF1B και PIM1 σε κύτταρα B –
CLL, μετά από ανάλυση δεδομένων αλληλούχησης RNA - seq, scRNA - seq και ATAC -
seq από τη βιβλιογραφία. Τα δεδομένα από τη βιβλιογραφία έδειξαν υπερέκφραση
των γονιδίων αυτών στα κύτταρα CLL και πως διαδραματίζουν ουσιαστικό ρόλο στην
αναστολή της απόπτωσης. Επίσης, δεδομένα ChIP – seq από τη βιβλιογραφία, όσον
αφορά τον μεταγωγέα σήματος και ενεργοποιητή της μεταγραφής 3 (Signal
Transducer and Activator of Transcription 3 – STAT3), ο οποίος εμπλέκεται σε αρκετές
αιματολογικές κακοήθειες, ανέδειξαν τον ουσιαστικό ρόλο που πιθανά
διαδραματίζουν τα microRNAs(μη κωδικά μόρια RNA) στην εξέλιξη και την πρόγνωση
της νόσου. Τέλος, παρήχθησαν λεντιιοί για αποσιώπηση του γονιδίου IKZF2 (IKAROS
Family Zinc Finger 2) στη B - CLL. Το γονίδιο IKZF2 αποτελεί μέλος της οικογένειας
μεταγραφικών παραγόντων Ikaros και διαδραματίζει ουσιαστικό ρόλο στην Οξεία
Λεμφοκυτταρική αλλά και Μυελογενή Λευχαιμία. Η διερεύνηση γονιδίων και
microRNAs που εμπλέκονται στην απόπτωση και στην επιβίωση των καρκινικών
κυττάρων, καθώς και μεταγραφικών παραγόντων που πιθανά συμμετέχουν στην
εξέλιξη της νόσου μπορεί να αποτελέσει τη βάση για νέες και αποτελεσματικές
θεραπευτικές προσεγγίσεις για τη νόσο.
(EL)
B – cell Chronic Lymphocytic Leukemia (B – CLL) is the most common leukemia in
adults in Western world and mostly affects elderly people. It is a malignancy in which
B – lymphocytes proliferate and accumulate in peripheral blood and lymphoid tissues
due to dysregulation, mostly, of apoptotic mechanisms. Furthermore, the continuous
activation of BCR (B cell Receptor) in B – lymphocytes caused by transcription factors
and, as a result, the activation of downstream signaling pathways, leads to activation
of genes that promote cellular proliferation and survival and inhibit apoptosis. In this
project, differential expression of PIM1 and TNFRSF1B gene in B – CLL cells is
practically investigated, following the RNA - seq, scRNA - seq and ATAC – seq
bibliographical data analysis. Data analysis revealed overexpression of those genes in
B – CLL cells as well as significant contribution to inhibition of the apoptotic process.
ChIP -seq data for Signal Transducer and Activator of Transcription 3 (STAT3), a factor
involved in several hematological malignancies, defined the importance of microRNAs
(non - coding RNAs), in development and prognosis of CLL cells. Finally, lentiviral
production, for knockdown of IKZF2 (IKAROS Family Zinc Finger 2) in Β - CLL cells has
been conducted. IKZF2 gene, a member of the Ikaros transcription factor family, is
known to contribute to the development of Acute Lymphocytic and Acute Myeloid
Leukemia, but its role in Chronic Lymphocytic Leukemia remains to be clarified.
Investigation of genes and microRNAs involved in inhibition of apoptosis and survival
of malignant cells and studying of transcription factors that possibly contribute to the
development of the disease could be fundamental for the discovery of future novel
and effective therapeutic approaches.
(EN)
/aggregator-openarchives/portal/institutions/uoa
