Σχεδιασμός, σύνθεση και μελέτη αναστολέων της εκκριτικής φωσφολίπασης Α2 με πιθανή δράση κατά της αθηροσκλήρωσης

Το τεκμήριο παρέχεται από τον φορέα :
University of Athens   

Αποθετήριο :
Pergamos Digital Library   

δείτε την πρωτότυπη σελίδα τεκμηρίου
στον ιστότοπο του αποθετηρίου του φορέα για περισσότερες πληροφορίες και για να δείτε όλα τα ψηφιακά αρχεία του τεκμηρίου*



Σχεδιασμός, σύνθεση και μελέτη αναστολέων της εκκριτικής φωσφολίπασης Α2 με πιθανή δράση κατά της αθηροσκλήρωσης

Βασιλακάκη Σοφία (EL)

born_digital_thesis
Διδακτορική Διατριβή (EL)
Doctoral Dissertation (EN)

2015


Οι εκκριτικές φωσφολιπάσες (sPLA2) είναι μία οικογένεια ενζύμων τα οποία έχουν ως κύριο ρόλο την υδρόλυση των φωσφολιπιδίων της κυτταρικής μεμβράνης στην θέση sn-2. Τα προϊόντα της καταλυτικής τους δράσης μεταβολίζονται μέσω διαφόρων βιολογικών οδών, συμβάλλοντας στο σχηματισμό της φλεγμονής. Η ομάδα ΙΙA (GIIA sPLA2) παρουσιάζει ιδιαίτερο ενδιαφέρον καθώς φαίνεται να εμπλέκεται στην εμφάνιση αθηροσκλήρωση και αθηροθρόμβωση. Στο εργαστήριο Οργανικής Χημείας του Τμήματος Χημείας, ΕΚΠΑ με υπεύθυνο το καθηγητή Γ. Κόκοτο έχει συντεθεί μια σειρά 2-οξοαμιδικών παραγώγων που έχουν δράση έναντι διαφόρων μελών των φωσφολιπασών Α2. Στην παρούσα εργασία, η δομή του 2-οξοαμιδικού παραγώγου της (S)-λευκίνης GK126, ένωση με ισχυρή ανασταλτική δράση, χρησιμοποιήθηκε για τον σχεδιασμό νέων ενώσεων. Πειράματα προσομοίωσης της μοριακής πρόσδεσης αυτών των ενώσεων, πραγματοποιήθηκαν με τη βοήθεια του προγράμματος GOLD. Οι ενώσεις που είχαν ευνοϊκά αποτελέσματα στα in silico πειράματα, συντέθηκαν και η δράση τους αξιολογήθηκε in vitro. Το 2-οξοαμιδικό παράγωγο της (S)-βαλίνης, είχε ισχυρή και εκλεκτική ανασταλτική δράση και ο τρόπος πρόσδεσης της ένωσης μελετήθηκε και σε πειράματα προσομοίωσης της μοριακής δυναμικής με τη βοήθεια του προγράμματος AMBER. Επίσης, στα πλαίσια της παρούσης εργασίας μελετήθηκε η πιθανή ανασταλτική δράση των παραγώγων της κουμαρίνης και της κινολινόνης, τα οποία σχεδιάστηκαν με βάση τη δομή γνωστών ινδολικών αναστολέων της GIIA sPLA2. Πειράματα προσομοίωσης της μοριακής πρόσδεσης των νέων δομών στο ενεργό κέντρο του ενζύμου πραγματοποιήθηκαν με το πρόγραμμα GOLD. Από τα αποτελέσματα προέκυψαν ενώσεις, οι οποίες μπορεί να αποτελέσουν νέους συνθετικούς στόχους. (EL)
Secreted phospholipase A2 (sPLA2) is a family of enzymes that catalyze the hydrolysis of membrane phospholipids at the sn-2 position. The products of this reaction are unsaturated fatty acids, which amplify the production of pre-inflammatory mediators. Group IIA sPLA2 has long been an important target for medicinal chemists as it is highly expressed in synovial cells and in atherosclerosis. Kokotos group has developed novel 2-oxoamides inhibitors against various PLA2s. Recently, a 2-oxoamide derivative based on (S)-leucine GK126 has shown potent inhibitory activity against GIIA sPLA2. Herein, the design of new potent inhibitors using GK126 as lead is described. Molecular docking simulations of the new compounds performed using the docking program GOLD. The derivatives presenting the most promising docking results were synthesized and their inhibitory activity was evaluated by in vitro studies. The 2-oxoamide derivative of (S)-valine GK241 showed a potent and selective inhibitory activity. Thus, molecular dynamics simulations using AMBER were also performed to further study its binding mode. In addition, new coumarin and quinolinone derivatives were designed starting from the structure of known indole inhibitors of GIIA sPLA2. Molecular docking simulations of these derivatives in GOLD showed that some of them could bind effectively on the active side of the enzyme and they represent new synthetic targets. (EN)


Ελληνική γλώσσα

Σχολή Θετικών Επιστημών » Τμήμα Χημείας » Τομέας ΙΙ [Οργανική Χημεία – Οργανική Χημική Τεχνολογία – Χημεία Τροφίμων]
Βιβλιοθήκη και Κέντρο Πληροφόρησης » Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών

https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/




*Η εύρυθμη και αδιάλειπτη λειτουργία των διαδικτυακών διευθύνσεων των συλλογών (ψηφιακό αρχείο, καρτέλα τεκμηρίου στο αποθετήριο) είναι αποκλειστική ευθύνη των αντίστοιχων Φορέων περιεχομένου.