1. Home page
  2. Search

Εφαρμογή φασματοσκοπίας πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού και μοριακής δυναμικής στη διαμορφωτική ανάλυση δύο C2-υποκατεστημένων διμερών πυρρολο[2,3-f]κινολινών

This item is provided by the institution :
/aggregator-openarchives/portal/institutions/uoa   

Repository :
Pergamos Digital Library   

see the original item page
in the repository's web site and access all digital files if the item*



Εφαρμογή φασματοσκοπίας πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού και μοριακής δυναμικής στη διαμορφωτική ανάλυση δύο C2-υποκατεστημένων διμερών πυρρολο[2,3-f]κινολινών
Βαρβαρίγου Νικολέττα (EL)
born_digital_postgraduate_thesis
Διπλωματική Εργασία (EL)
Postgraduate Thesis (EN)
2011
Στην παρούσα διπλωματική εργασία πραγματοποιήθηκε διαμορφωτική ανάλυση δυο C2-υποκατεστημένων [2,3-f]κινολινών που παρουσιάζουν κυτταροτοξικό χαρακτήρα και πιθανή αντικαρκινική δράση. Αρχικά μελετήθηκαν τα πειραματικά δεδομένα φασματοσκοπίας Πυρηνικού Μαγνητικού Συντονισμού μίας και δύο διαστάσεων για τη διερεύνηση των διαμορφώσεων που λαμβάνουν οι ενώσεις. Στη συνέχεια, πραγματοποιήθηκε διαμορφωτική ανάλυση των ενώσεων με τη βοήθεια υπολογιστικών μεθόδων μοριακής δυναμικής υπό συνθήκες κενού, υδατικού περιβάλλοντος και περιβάλλοντος διαλύτη διμεθυλοσουλφοξειδίου (DMSO). Ακολούθως, οι ενώσεις μελετήθηκαν για την ικανότητά τους να διαπερνούν τον υδάτινο φραγμό των λιπιδικών διπλοστιβάδων και να εισέρχονται σε αυτές, με πειράματα μοριακής δυναμικής. Τέλος, μελετήθηκε η μοριακή πρόσδεση των ενώσεων αυτών σε αλληλουχίες νουκλεοτιδίων (DNA) για τη διερεύνηση του τρόπου δράσης τους. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι οι ενώσεις αυτές στα διάφορα περιβάλλοντα και στόχους δράσης λαμβάνουν εκτεταμένες δομές, σε συμφωνία με τα πειραματικά δεδομένα NMR όπου δεν παρατηρήθησαν μεγάλης εμβέλειας NOEs. Η βιολογική σημασία αυτών των αποτελεσμάτων είναι υπό μελέτη. (EL)
In the present thesis a conformational analysis of two C2-substituted [2,3-f] quinolines presenting cytotoxic and potential anticancer activity was applied. Initially, the experimental data of one- and two- dimensional nuclear magnetic resonance spectra were analyzed to structurally elucidate them and search their conformational properties. Then, a conformational analysis of the compounds under study was performed, using computational methods and molecular dynamics procedures in vacuum, in water solution environment and in DMSO solution environment. Subsequently, the compounds were studied for their ability to cross the water barrier of lipid bilayers and enter within the bilayer core using molecular dynamics experiments. Finally, the molecular docking of these compounds in nucleotide sequences (DNA) was studied, in order to investigate their mode of action, as DNA constitutes their target. The obtained results showed that these compounds adopt an extended conformation in all environments studied. This is in accordance with NMR data which showed no wide range NOEs. The biological consequences of these results are under study. (EN)
Greek
Σχολή Θετικών Επιστημών » Τμήμα Χημείας » Τομέας Ι [Θεωρητική Χημεία – Φυσικοχημεία – Ανόργανη Ανάλυση – Ενόργανη Ανάλυση – Οργανολογία – Χημική Μηχανική (Εφαρμ. Φυσικοχημεία)]
Βιβλιοθήκη και Κέντρο Πληροφόρησης » Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
University of Athens
Pergamos Digital Library
Postgraduate Thesis



*Institutions are responsible for keeping their URLs functional (digital file, item page in repository site)