Ερευνήθηκε ο ρόλος των μονονουκλειτιδικών αλλαγών (SNPS) στο γονίδιο ALOX5AP και η πιθανότητα εμφάνισης ΑΕΕ στον Ελληνικό πληθυσμό. Με την μέθοδο HRMA εξετάσθηκε με αλληλούχηση ολόκληρη η κωδικοποιούσα περιοχή στα πέντε εξόνια καθώς και στις γειτονικές ιντρονικές περιοχές του γονιδίου. Στα δείγματα όπου κατά την διαδικασία HRMA έδειξαν πρότυπο διαφορετικό του φυσιολογικού ακολούθησε ανάλυση της πρωτοταγούς δομής για την εύρεση γενετικών αλλαγών με την μέθοδο της αλληλούχισης του DNA.Οι ασθενείς (213) κατηγοριοποιήθηκαν σύμφωνα με την κατάταξη TOAST. Μάρτυρες: 210 άτομα ιδίας ιθαγενείας, φύλου και ηλικίας, χωρίς ιστορικό ΑΕΕ και στεφανιαίας νόσου, μέση ηλικία 66 ετών.rs4769055: CA/ΑΑ, προστατευτικοί για την ανάπτυξη ΑΕΕ, από την στιγμή που οι φορείς έδειξαν 45% και 91,5% αντίστοιχα μικρότερη πιθανότητα κινδύνου για ΑΕΕ.rs202068154: C σε ετεροζυγωτία είτε σε ομοζυγωτία: 85% μικρότερη πιθανότητα για ανάπτυξη ΑΕΕ.rs3803277: CA/ΑΑ, 66% και 82%, μικρότερη πιθανότητα για ΑΕΕ από νόσο των μικρών αγγείων, παρά από οποιοδήποτε άλλον υπότυπο ΑΕΕ. Όλα τα ανωτέρω SNPs τοποθετούνται στις ιντρονικές περιοχές του γονιδίου και σύμφωνα με προγράμματα in silico ΕΧ_SKIP και HSF, επηρεάζουν το μάτισμα των εξονίων 1 και 2 του ALOX5AP.
ALOX5AP has been recognized as a susceptibility gene for stroke. The whole coding and adjoining intronic regions of ALOX5AP was sequenced to study the role of SNPs and their interplay with other risk factors in Greek patients with stroke. Patients (n=213) were classified by TOAST. Their mean age of was 58.9±14.64, comprising 145 males. The control group consisted of 210 subjects, ethnicity, sex and age matched, with no stroke history. Risk factors (hyperlipidemia, hypertension, atrial fibrillation, migraine, CAD, diabetes, smoking and alcohol consumption) were assessed as confounding factors and comparisons were done using logistic regression analysis. SNPs rs4769055, rs202068154 and rs3803277 located in intronic regions of the gene and according to in silico programs EX_SKIP and HSF possibly affecting splicing of exons 1 and 2 of ALOX5AP, showed significantly different frequencies between patients and controls. The genotype frequencies of rs4769055: AA, of rs202068154: AC and of rs3803277: CA were significantly higher (p<0.001, 0.058) in controls than in patients. The results were indicative of a protective role of the three SNPs either in homozygosity or heterozygosity for MAF and more specifically rs3803277: CA/AA genotypes were protective against SVO stroke subtype.
National Documentation Centre (EKT)
